استنباط بیزی برای مطالعه کنترل ژنتیکی تحمل به تنش کم آبی در گندم با استفاده از روش LASSO

Publish Year: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 172

This Paper With 16 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_CRGU-8-1_005

تاریخ نمایه سازی: 3 آبان 1400

Abstract:

خشکی مهم­ترین تنش غیرزیستی است که به­طور جدی تولید و کیفیت محصول گندم ایران را تحت تاثیر قرار می­دهد. اطلاعات درباره کنترل ژنتیکی توارث تحمل به تنش برای تعیین نوع برنامه اصلاحی و تولید ارقام متحمل ضروری است. در این مطالعه، استنباط بیزی با به­کارگیری روش LASSO برای شناسایی مهم­ترین آثارژنتیکی مرتبط با تحمل به خشکی در چارچوب روش تجزیه میانگین نسل­ها مورد استفاده قرار گرفت. به­همین منظور آزمایش­هایی شامل دو جفت تلاقی بین ارقام حساس و متحمل (هامون × دریا و سپاهان × مروارید) و نسل­های حاصل از تلاقی آن­ها برای دو سال به­صورت کرت­های خردشده در دو شرایط آبیاری مطلوب و قطع آبیاری از زمان گرده­افشانی بر پایه طرح بلوک­های کامل تصادفی با سه تکرار اجرا شدند. استنباط بیزی یک روش جایگزین مناسب است که دانش پیشین موجود (توزیع پیشین) را با اطلاعات حاصل از داده­ها ترکیب می­کند و یک توزیع احتمالی (توزیع پسین) را نتیجه می­دهد که از تمام اطلاعات برای تفسیر ساختار ژنتیکی برخوردار است. LASSO یک روش موثر برای اعمال انقباض و گزینش بر آثارمدل است. ضرایب آثارغیرمهم در مدل به سمت صفر منقبض می­شوند و از مدل کنار گذاشته می­شوند، در حالی­که انقباض کم­تری برای ضرایب مهم به­کار برده می­شود. از آنجا که عمل ژنی افزایشی، غالبیت و اپیستازی در توارث عملکرد دانه در شرایط تنش و غیرتنش درگیر بودند، روش­هایی که از تمام آثارژنی استفاده کنند، مانند گزینش دوره­ای و به دنبال آن روش شجره­ای می­تواند روشی سودمند برای بهبود تحمل به تنش خشکی باشد.

Keywords:

Authors

سیده فاطمه دانیالی

دانشجوی دکتری، گروه به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران

پرویز صفری

دانش آموخته دکتری، گروه به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز،تبریز، ایران

مهدی رحیمی

استادیار، گروه بیوتکنولوژی، پژوهشکده علوم محیطی، پژوهشگاه علوم و تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته، کرمان، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Balestre, M., Von Pinho, R. G. and Brito, A. H. ...
  • Bartlett, M. S. ۱۹۵۷. Measles periodicity and community size. Journal of ...
  • Blasco, A. ۲۰۰۱.The Bayesian controversy in animal breeding. Journal of Animal ...
  • Chowdhry, M. A., Rafiq, M. and Alam, K. ۱۹۹۲.Genetic architecture ...
  • Dellaportas, P., Forster, J. J. and Ntzoufras, I. ۲۰۰۲.On Bayesian ...
  • Fotokian, M. H., Ahmadi, J. and F. Orang, S. ۲۰۰۸. ...
  • Gelfand, A. E. and Smith, A. F. ۱۹۹۰.Sampling-based approaches to ...
  • Geman,S.andGeman,D.۱۹۸۴.Stochasticrelaxation,Gibbsdistributions and the Bayesian restoration of images. IEEE Transactions on Pattern ...
  • Gomez, K. A. and Gomez, A. A. ۱۹۸۴. Statistical procedures for ...
  • Hastings, W. K. ۱۹۷۰.Monte Carlo sampling methods using Markov chains ...
  • Ijaz, U. S. and Kashif, M. ۲۰۱۳. Genetic study of ...
  • Kearsey, M. J. and Pooni, H. S. ۱۹۹۸. The genetical analysis ...
  • Khattab, S. A. M., Esmail, R. M. and Al-Ansary, A. ...
  • Kuo, L. and Mallick, B. ۱۹۹۸.Variable selection for regression models. Sankhyā: ...
  • Lindley, D.V. ۱۹۵۷.A statistical paradox. Biometrika ۴۴(۱-۲): ۱۸۷-۱۹۲ ...
  • Lykou, A. and Ntzoufras, I. ۲۰۱۱.WinBUGS: A tutorial. Wiley Interdisciplinary Reviews: ...
  • Lykou, A. and Ntzoufras, I. ۲۰۱۳. On Bayesian lasso variable ...
  • Lynch, S. M. ۲۰۰۷. Introduction to applied Bayesian statistics and estimation ...
  • Mather, K. and Jinks, J. L. ۱۹۷۱.Biometrical genetics. Cornell University Press, ...
  • Mathew, B., Bauer, A. M., Koistinen, P., Reetz, T. C., ...
  • Metropolis,N.,Rosenbluth,A.W.,Rosenbluth,M.N.,Teller,A.H.andTeller,E.۱۹۵۳. Equation of statecalculationsbyfastcomputingmachines. TheJournalofChemicalPhysics ۲۱:۱۰۸۷-۱۰۹۲ ...
  • Mettle, F. O., Asiedu, L., Quaye, E. N. and Asare-Kumi, ...
  • Munir, M., Chowdhry, M. A. and Ahsan, M. ۲۰۰۷.Generation means ...
  • Nezhadahmadi, A., Prodhan, Z. H. and Faruq, G. ۲۰۱۳.Drought tolerance ...
  • Novoselovic, D., Baric, M., Drezner, G., Gunjaca, J. and Lalic, ...
  • Ntzoufras, I. ۲۰۱۱. Bayesian modeling using WinBUGS. Vol. ۶۹۸.John Wiley & ...
  • SAS Institute. ۲۰۰۲. SAS user's guide: Statistics version ۹ for ...
  • Spiegelhalter, D. J., Thomas, A., Best, N. G. and Lunn, ...
  • Tibshirani, R. ۱۹۹۶.Regression shrinkage and selection via the lasso. Journal of ...
  • Waldmann, P., Hallander, J., Hoti, F. and Sillanpää, M. J. ...
  • Wang, D., El-Basyoni, I.S., Baenziger, P.S., Crossa, J., Eskridge, K.M. ...
  • Wang, D., Eskridge, K.M. and Crossa, J. ۲۰۱۱.Identifying QTLs and ...
  • Xu, S. ۲۰۰۳.Estimating polygenic effects using markers of the entire ...
  • Xu, S. ۲۰۰۷.An empirical Bayes method for estimating epistatic effects ...
  • نمایش کامل مراجع