ردیابی مناطق تحت انتخاب مثبت در برخی از بزهای اهلی و وحشی ایران با استفاده از نشانگرهای مولکولی

شناسایی این نشانه ها یکی از بحثهای مورد علاقه متخصصان ژنتیک تکاملی است، زیرا میتوانند اطلاعاتی از فرایندهای تکاملی تشکیل ژنوم تا اطلاعات عملکردی از نواحی ژنگانی را با شناسایی این نواحی به دست آورند. شناسایی نشانه های انتخاب ممکن است منجر به شناسایی مناطق مرتبط با صفات مهم که تحت انتخاب هستند شود. در این مطالعه، با هدف شناسایی مناطق تحت انتخاب مثبت بین گونه های اهلی و وحشی بز ایرانی، یک پویش گسترده در ژنوم با استفاده از چندشکلی های تک نوکلئوتیدی (SNP) انجام شد. داده های مطالعه حاضر از پروژه NEXTGENE گرفته شد. در این پژوهش ۲۰ راس بز اهلی و ۱۸ راس بز وحشی با تراشه های شرکت ایلومینا توالی یابی کل ژنوم شدند. برای مطالعه جهشها در کل ژنوم برای هر حیوان، ابتدا جهش های معادل ۵۰K شرکت ایلومینا استخراج شد. در این مطالعه برای شناسایی مناطق تحت انتخاب مثبت از آماره FST استفاده شد. نتایج آزمون FSTبین دو جمعیت اهلی و وحشی نشان داد که ۴۸۰منطقه ژنومی روی ۲۹ کروموزوم متاثر از انتخاب بودند. ژن های شناسایی شده با تنظیم اتوفاژی، تجزیه لیزین، چسبندگی سلولی، مسیر سیگنال دهی فسفولیپاز D، فعالسازی پلاکت، سیناپس گلوتاماتیک، سیناپس سروتونرژیک، مسیر سیگنال دهی گنادوتروپین و مسیر سیگنال دهی برای تمایز مناسب سلولهای جنینی در ارتباط بودند. نتایج این مطالعه نشان داد که شناسایی امضاهای انتخاب ممکن است درک بهتری از فرایند اهلی سازی داشته باشد و ژن های نامزد میتوانند در این فرایند سهیم باشند. با توجه به کوچک بودن جمعیت مورد مطالعه و کامل نبودن اطلاعات مربوط به حاشیه نویسی عملکردی ژنها در گونه بز، مطمئنا مطالعات گسترده تر با تعداد نمونه های بیشتر، درک بهتری از ژنهای کاندید برای صفات مهم اقتصادی در گونه های اهلی و وحشی و طراحی برنامه های اصلاح نژادی موفق، ایجاد خواهد نمود.

Keywords:

بز اهلی و وحشی , نشانه های انتخاب , FST , SNP