طراحی سازه ژنی ترکیبی جهت تولید نوترکیب باکتریوسین لاتروسپورولین و آنالیز بیوانفورماتیکی پیش ساز پروتئینی با هدف بررسی نقش انتهای آمینی دمین ۲SH

Publish Year: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 279

This Paper With 9 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_AEJO-12-4_073

تاریخ نمایه سازی: 12 آبان 1400

Abstract:

باکتریوسین­ ها پپتیدهای تولید شده توسط باکتری ­ها می­ باشند که فعالیت ضدمیکروبی این پپتیدها بر علیه باکتری ­ها و قارچ­ ها شناخته شده است. به­  منظور تولید مقادیر بالای باکتریوسین با استفاده از فناوری DNA نوترکیب و نیاز به خنثی کردن اثر سمی پپتید و تولید فرم محلول پروتئین می ­توان از برخی پپتیدها که به ­عنوان چاپرون ­ها عمل می ­کنند، استفاده نمود. لاتروسپورولین یک باکتریوسین ۴۹ اسیدآمینه ­ای می ­باشد که به ­طور طبیعی از باکتری ۹-Brevibacillus laterosporus GI ترشح می­ شود. در مطالعه حاضر، برای اولین بار از انتهای آمینی دمین ۲SH به ­عنوان قطعه پپتیدی کمکی جهت تولید نوترکیب باکتریوسین لاتروسپورولین استفاده شد. در این مطالعه سازه ژنی ترکیبی به­ صورت پیش­ ساز پروتئینی حاوی دنباله هیستیدینی، انتهای آمینی دمین ۲SH (۲N-SH)، جایگاه برش پروتئاز انتروکیناز و در نهایت پپتید لاتروسپورولین طراحی گردید و به ­کمک آنالیزهای بیوانفورماتیکی اثر دمین ۲N-SH بر حلالیت و سطوح آب گریز پروتئین هدف مطالعه شد. نتایج نشان داد دمین ۲N-SH با دارا بودن سطوح مناسب آب گریز می­ تواند به ­عنوان یک چاپرون مناسب، مانع از مجتمع شدن و به­ هم ریختگی ساختاری غیرقابل برگشت باکتریوسین لاتروسپورولین گردد. به ­علاوه آنالیزهای انجام شده نشان داد امکان بیان پروتئین هدف با تاخوردگی مناسب در شرایط آزمایشگاهی وجود دارد. مطالعه حاضر نشان داد دمین ۲N-SH می ­تواند به ­عنوان یک گزینه مناسب جهت تولید نوترکیب انواع باکتریوسین ­ها در باکتریاشریشیا کلی عمل نماید.

Keywords:

Authors

سیمین صالح زاده

گروه پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران

محمد طباطبایی

گروه پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران

عبداله درخشنده

گروه پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران

حمید رضا کربلایی حیدری

گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Ahmad, S.; Banville, D.; Zhao, Z.; Fischer, E.H. and Shen, ...
  • Chatterjee, D.K. and Esposito, D., ۲۰۰۶. Enhanced soluble protein expression ...
  • Cotter, P.D.; Hill, C. and Ross, R.P., ۲۰۰۵. Food microbiology: ...
  • Demain, A.L. and Vaishnav, P., ۲۰۰۹. Production of recombinant proteins ...
  • Dyson, M.R.; Shadbolt, S.P.; Vincent, K.J.; Perera, R.L. and McCafferty, ...
  • Esposito, D. and Chatterjee, D.K., ۲۰۰۶. Enhancement of soluble protein ...
  • Fairlie, W.D.; Uboldi, A.D.; De Souza, D.P.; Hemmings, G.J.; Nicola, ...
  • Fimland, G.; Blingsmo, O.R.; Sletten, K.; Jung, G.; Nes, I.F. ...
  • Fontana, M.B.C.; de Bastos, M.D.C.F. and Brandelli, A., ۲۰۰۶. Bacteriocins ...
  • Fox, J.D.; Kapust, R.B. and Waugh, D.S., ۲۰۰۱. Single amino ...
  • Guyonnet, D.; Fremaux, C.; Cenatiempo, Y. and Berjeaud, J. M., ...
  • Hebditch, M.; Carballo-Amador, M.A.; Charonis, S.; Curtis, R. and Warwicker, ...
  • Hebditch, M. and Warwicker, J., ۲۰۱۹. Web-based display of protein ...
  • Jack, R.W.; Tagg, J.R. and Ray, B., ۱۹۹۵. Bacteriocins of ...
  • James, R.; Lazdunski, C. and Pattus, F., ۲۰۱۳. Bacteriocins, microcins ...
  • Jana, S. and Deb, J.K., ۲۰۰۵. Retracted Article: Strategies for ...
  • Kleerebezem, M.; Beerthuyzen, M.M.; Vaughan, E.E.; De Vos, W.M. and ...
  • Laskowski, R.A.; MacArthur, M.W.; Moss, D.S. and Thornton, J.M., ۱۹۹۳. ...
  • Li, C.; Haug, T.; Styrvold, O.B.; Jørgensen, T.Ø. and Stensvåg, ...
  • Li, J.F.; Zhang, J.; Zhang, Z.; Kang, C.T. and Zhang, ...
  • Malhotra, A., ۲۰۰۹. Tagging for protein expression. In Methods in enzymology. Vol. ...
  • Mayer, B.J., ۲۰۱۷. What Have We Learned from SH۲ Domains? ...
  • McAuliffe, O.; Ross, R.P. and Hill, C., ۲۰۰۱. Lantibiotics: structure, ...
  • McCoy, J. and La Ville, E., ۱۹۹۷. Expression and purification ...
  • Miller, K.W.; Schamber, R.; Osmanagaoglu, O. and Ray, B., ۱۹۹۸. ...
  • Mohammad, N.; Karsabet, M.T.; Amani, J.; Ardjmand, A.; Zadeh, M.R.; ...
  • Morris, A.L.; MacArthur, M.W.; Hutchinson, E.G. and Thornton, J.M., ۱۹۹۲. ...
  • Nascimento, J.S.; Ceotto, H.; Nascimento, S.B.; Giambiagi‐deMarval, M.; Santos, K.R.N. ...
  • Niwa, T.; Ying, B.W.; Saito, K.; Jin, W.; Takada, S.; ...
  • Pacheco, B.; Crombet, L.; Loppnau, P. and Cossar, D., ۲۰۱۲. ...
  • Parachin, N.S.; Mulder, K.C.; Viana, A.A.B.; Dias, S.C. and Franco, ...
  • Pawson, T., ۲۰۰۴. Specificity in signal transduction: from phosphotyrosine-SH۲ domain ...
  • Riley, M.A.; Goldstone, C.M.; Wertz, J.E. and Gordon, D., ۲۰۰۳. ...
  • Riley, M.A., ۱۹۹۸. Molecular mechanisms of bacteriocin evolution. Annual review ...
  • Singh, P.K.; Sharma, V.; Patil, P.B. and Korpole, S., ۲۰۱۲. ...
  • Singh, P.K.; Solanki, V.; Sharma, S.; Thakur, K.G.; Krishnan, B. ...
  • Skosyrev, V.S.; Kulesskiy, E.A.; Yakhnin, A.V.; Temirov, Y.V. and Vinokurov, ...
  • Sørensen, H.P. and Mortensen, K.K., ۲۰۰۵. Soluble expression of recombinant ...
  • Sun, Y.; Li, Q.; Li, Z.; Zhang, Y.; Zhao, J. ...
  • Svetoch, E.A.; Stern, N.J.; Eruslanov, B.V.; Kovalev, Y.N.; Volodina, L.I.; ...
  • Terpe, K., ۲۰۰۶. Overview of bacterial expression systems for heterologous ...
  • Tagg, J.R.; Dajani, A.S. and Wannamaker, L.W., ۱۹۷۶. Bacteriocins of ...
  • Wang, Y.; Henz, M.E.; Fregeau Gallagher, N.L.; Chai, S.; Gibbs, ...
  • Xu, X.; Jin, F.; Yu, X.; Ren, S.; Hu, J. ...
  • نمایش کامل مراجع