روابط فیلوژنتیکی گربه وحشی (Felis lybica/Felis silvestris) در ایران با استفاده از ژن میتوکندریایی NADH۵ و امکان سنجی شناسایی گربه وحشی آسیایی (F. lybica ornata) به وسیله این نشانگر

Publish Year: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 249

This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_AEJO-12-2_001

تاریخ نمایه سازی: 16 آبان 1400

Abstract:

The wildcat is one of the wild felids with the wide distribution and has a potential and distinctive threat from other felids that is introgression with domestic cat. Iran is at the intersection of two species of wildcat i.e. Felis lybica and Felis silvestris, however there is lack of information regarding taxonomic situation and hybridization of wildcat in Iran. In present study we sequenced ۸۱۴ bp fragment of the mitochondrial NADH۵ gene of ۳۸ sampled wildcats from Iran to assess the genetic diversity and phylogenetic relationships of the species. The phylogenetic analyses represented two distinct subclades in Iran. The sequences of ND۵ from Iranian samples in combination with ۳۲ sequences of wildcats from GenBank, did not revealed a distinct subclade and they situated among the sequences of the Asiatic Wildcat and the African Wildcat and domestic cat. Twelve closely related haplotypes were identified for the entire country, with two geographical distinct locations for western and eastern Zagros Mountain Range and overlapping in some areas. The statistical analyses of fixation index (FST) and molecular variance (AMOVA) illustrated significant genetic structure between two subclades (FST=۰.۶۶). Nucleotide (G) has located in the position of ۱۳۷۷۶ on the NADH۵ that provides possibility of Asiatic Wildcat (F. l. ornata) identification. Accordingly ۲۴ samples out of ۳۸ specimens in this research were recognized as the Asiatic Wildcat in the prior assessment that this finding was in accordance with the phylogenetic Bayesian tree. Meanwhile the Asiatic subclade revealed a higher genetic diversity than the African subclade.

Keywords:

Authors

سیده مرضیه موسوی

گروه محیط زیست، دانشکده منابع طبیعی و محیط زیست، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران

حمیدرضا رضایی

گروه محیط زیست، دانشکده شیلات و محیط زیست، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگان، ایران

سعید نادری

گروه محیط زیست، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • اسدی، م.؛ رضایی، ح. و زمانی، ن.، ۱۳۹۲. تبارشناسی زیرگونه های ...
  • پیش بینی پراکنش بالقوه گربه وحشی Felis silvestris با استفاده از الگوریتم حداکثر انتروپی در ایران [مقاله ژورنالی]
  • Baca, M.; Popović, D.; Panagiotopoulou, H.; Marciszak, A.; Krajcarz, M.; ...
  • Bandelt, H.J.; Forster, P. and Röhl, A., ۱۹۹۹. Median-joining networks ...
  • Daniels, M.J.; Beaumont, M.A.; Johnson, P.J.; Balharry, D.; Macdonald, D.W. ...
  • Devillard, S.; Jombart, T.H.; Léger, F.; Pontier, D.; Say, L. ...
  • Driscoll, C.A.; Menotti -Raymond, M.; Roca, A.L.; Hupe, K.; Johnson, ...
  • Driscoll, C.; Yamaguchi, N.; O’Brien, S.J. and MacDonald, D.W., ۲۰۱۱. ...
  • Excoffier, L. and Lischer, H.E.L., ۲۰۱۰. Arlequin suite ver ۳.۵: a ...
  • Ghoddousi, A.; Hamidi, A.K.; Ghadirian, T. and Baniasadi, S., ۲۰۱۶. The ...
  • Kilshaw, K.; Johnson, P.J.; Kitchener, A.C. and Macdonald, D., ۲۰۱۴. ...
  • Kitchener, A.C.; Yamaguchi, N.; Ward, J.M. and Macdonald, D.W., ۲۰۰۵. A ...
  • Kitchener, A.C.; Britenmoser-Wursten, C.H.; Eiziruk, E. and Gentry, A., ۲۰۱۷. ...
  • Librado, P. and Rozas, J., ۲۰۰۹. DnaSP v۵: a software ...
  • Lopez, J.V.; Culver, M.; Stephens, J.C.; Johnson, W.E. and O’Brien, ...
  • Macdonald, D.W. and Loveridge, A.J., ۲۰۱۰. Bi­ology and conservation of ...
  • Mouthereau, F.; Lacombe, O. and Vergés, J., ۲۰۱۲. Building the ...
  • Nowell, K. and Jackson P., ۱۹۹۶. Wild cats: Status survey and ...
  • O’Brien, J.; Devillard, S.; Say, L.; Vanthomme, H.; Leger, F.; ...
  • Ottoni, C.; Van Neer, W.; De Cupere, B.; aligault, J.; ...
  • Posada, D., ۲۰۰۸. JModelTest: phylogenetic model averaging. Molecular Biology and ...
  • Purvis, A.; Gittleman, J.L. and Brooks, T.H., ۲۰۰۵. Phylogeny and ...
  • Ragni, B. and Possenti, M., ۱۹۹۶. Variability of coat‐colour and ...
  • Ronquist, F. and Huelsenbeck, J.P., ۲۰۰۳. MrBayes ۳: Bayesian phylogenetic ...
  • Sagheb-Talebi, K.; Sajedi, T. and Pourhashemi, M., ۲۰۱۴. Forests of ...
  • Say, L.; Devillard, S.; Leger, F.; Pontier, D. and Ruette, ...
  • Senn, H.V.; Ghazali, M.; Kaden, J.; Barclay, D.; Harrower, B.; ...
  • Tamada, T.; Kurose, N. and Masuda, R., ۲۰۰۵. Genetic diversity ...
  • Tamura, K.; Stecher, G.; Peterson, D.; Filipski, A. and Kumar, ...
  • Yamaguchi, N.; Driscoll, C.H.; Kitchener, A.C.; Ward, J.M. and Macdonald, ...
  • Weir, B.S. and Cockerham, C.C., ۱۹۸۴. Estimating F-statistics for the ...
  • نمایش کامل مراجع