فیلوژنی مولکولی Vetigastropoda براساس ژن های میتوکندریایی COI و S rRNA۱۶

Publish Year: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 169

This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_AEJO-10-2_033

تاریخ نمایه سازی: 16 آبان 1400

Abstract:

       در این پژوهش روابط فیلوژنی بین گونه ­های کلاد Vetigastropoda در آب­ های ساحلی خلیج فارس مورد بررسی قرار گرفت. بدین منظور از ژن ­های میتوکندریایی COI و S rRNA۱۶ استفاده شد. نمونه ­برداری در سال ­های ۱۳۹۲ و ۱۳۹۳ در سواحل صخره­ای شمال خلیج­فارس انجام گرفتو نمونه ­ها مورد شناسایی مورفولوژیک قرار گرفتند. سپس مراحل استخراج DNA، تکثیر قطعه ژنی زیر واحد I سیتوکروم اکسیداز (COI) و S rRNA۱۶ و توالی­یابی انجام شد. در مجموع تعداد ۹ توالی COI و ۵ توالی S rRNA۱۶ متعلق به ۵ گونه از این کلاد به ­دستآمد که این توالی ­ها برای اولینبار از منطقه شمالی خلیج ­فارس گزارش شده است.آنالیزهایفیلوژنی با استفاده از نرم ­افزارهای MEGA۶، PAUP و BEAST و با رسم درخت­ های فیلوژنی Maximum Likelihood، Maximum Parsimony و Bayesian صورت گرفت. نتایج نشان داد کلاد Vetigastropoda که از نظر رده ­بندی سنتی خانواده ­های Trochidae، Chilodontidae، Turbinidae و Fissurellidae از این مطالعه را، شامل می ­شود، مونوفیلتیک نمی ­باشد. به این ترتیب که گونه ­های متعلق به خانواده­ های Trochidae و Chilodontidae در یک کلاد مجزا از گونه ­های متعلق به دو خانواده Turbinidae و Fissurellidae قرار گرفتند. این مطلب نشان دهنده رابطه غیرخواهری میان این دو گروه بوده که بیانگر تفاوت بین دیدگاه رده ­بندی سنتی و رده ­بندی مولکولی است.

Authors

منا ایزدیان

گروه تنوع زیستی و ایمنی زیستی، پژوهشکده محیط زیست و توسعه پایدار، سازمان حفاظت محیط زیست

حسین ذوالقرنین

گروه بیولوژی دریا، دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی، دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر

سیدمحمدباقر نبوی

گروه بیولوژی دریا، دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی، دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر

آریا اشجع اردلان

گروه زیست شناسی دریا، دانشکده علوم و فنون دریایی، دانشگاه دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران شمال، صندوق پستی: ۱۸۱- ۱۹۷۳۵

سیامک یوسفی سیاه کلرودی

گروه زیست شناسی، دانشکده علوم زیستی، واحد ورامین- پیشوا، دانشگاه آزاد اسلامی ورامین، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • حسین ­زاده ­صحافی، ه.؛ دقوقی، ب. و رامشی، ح.، ۱۳۷۹. ...
  • Collin, R., ۲۰۰۳. Phylogenetic relationships among calyptraeid gastropods and their ...
  • Donald, K.M.; Kennedy, M. and Spencer, G.S., ۲۰۰۵. Cladogenesis as ...
  • Drummond, A.J.; Suchard, M.A.; Xie, D. and Rambaut, A., ۲۰۱۲. ...
  • Elpidio, A.R. and Hebert, P.D.N., ۲۰۰۳. Testing the utility of ...
  • Folmer, O.; Black, M.; Hoeh, W.; Lutz, R. and Vrijenhoek, ...
  • Frey, M. and Vermeij, G.J., ۲۰۰۸. Molecular phylogenies and historical ...
  • Geiger, D.L. and Thacker, C.R., ۲۰۰۵. Molecular phylogeny of Vetigastropoda ...
  • Haase, M. and Zielske, S., ۲۰۱۵. Molecular phylogeny and a ...
  • Jones, D.A., ۱۹۸۶. A field guide to the sea shores ...
  • Kano, Y., ۲۰۰۸. Vetigastropod phylogeny and a new concept of ...
  • Knudsen, B.; Knudsen, T.; Flensborg, M.; Sandmann, H.; Heltzen, M.; ...
  • Larsson, A., ۲۰۱۴. AliView: a fast and lightweight alignment viewer ...
  • Layton, K.; Martel, A.L. and Hebert, P.D.N., ۲۰۱۴. Patterns of DNA ...
  • Lemey, P.; Salemi, M. and Vandamme, A.M., ۲۰۰۹. The Phylogenetic ...
  • Maddison, W.P., ۱۹۹۷. Gene Trees in Species Trees. Systematic Biology. ...
  • McPherson, M.J. and Møller, S.G., ۲۰۰۶. PCR Second Edition. Taylor ...
  • Medina, M.; Weil, E. and Szmant, A.M., ۱۹۹۹. Examination of ...
  • Nylander, J.A.A., ۲۰۰۴. MrModeltest v۲. Program distributed by the author. ...
  • Palumbi, S.R.; Martin, A.; Romano, S.; McMillan, W.O.; Stice, L. ...
  • Quintero-Galvis, J. and Castro, L.R., ۲۰۱۳. Molecular phylogeny of the ...
  • Remigio, E.A. and Hebert, P.D.N., ۲۰۰۳. Testing the utility of ...
  • Robin, A., ۲۰۰۸. Encyclopedia of Marine Gastropods, Ed. IKAN Unterwasser ...
  • Rodríguez, F.; Oliver, J.F.; Marín, A. and Medina, J.R. ۱۹۹۰. The ...
  • Ronquist, F. and Huelsenbeck, J.P., ۲۰۰۳. MRBAYES۳: Bayesian phylogenetic inference ...
  • Sotelo, G.; Morán, P. and Posada, D., ۲۰۰۹. Molecular phylogeny ...
  • Strong, E.E. and Bouchet, P., ۲۰۱۳. Cryptic yet colorful: anatomy ...
  • Swofford, D.L., ۲۰۰۳. PAUP. Phylogenetic Analysis Using Parsimony (and Other ...
  • Tamura, K.; Peterson, D.; Peterson, N.; Stecher, G.; Nei, M. ...
  • Thompson, J.D.; Higgins, D.G. and Gibson, T.J., ۱۹۹۴. CLUSTAL W: improving ...
  • نمایش کامل مراجع