بررسی کاربرد توالی یابی ناحیه کنترلی (D loop) DNA میتوکندریایی در مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت های تاسماهی ایرانی (Acipenser persicus Borodin, ۱۸۹۷) دریای خزر

Publish Year: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 340

This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ISFJ-29-1_006

تاریخ نمایه سازی: 20 آبان 1400

Abstract:

هدف از تحقیق حاضر بررسی تعیین ساختار ژنتیک جمعیت تاسماهی ایرانی (Acipenser persicus) دریای خزر با روش توالی­یابی قطعه ناحیه کنترلی DNA میتوکندریایی بود. برای این منظور، تعداد ۴۵ نمونه باله تاسماهی ایرانی از آب­های ساحلی مناطق مختلف دریای خزر جمع­آوری گردید. ناحیه کنترلی با استفاده از روش PCR تکثیر و توالی­ یابی با استفاده از روش استاندارد انجام پذیرفت. تعداد ۱۲هاپلوتیپ متفاوت در بین نمونه­های بررسی شده، مشاهده گردید. تنوع هاپلوتایپی و نوکلئوتیدی در نمونه­ ها به­ترتیب برابر با ۰۳۷/۰ ± ۷۹۵/۰ و ۰۰۴۶/۰ ± ۰۰۶۲/۰ بدست آمد. بیشترین تعداد هاپلوتایپ (۷ عدد) در بین نمونه­های رودخانه سفیدرود بود که از این تعداد ۳ هاپلوتایپ A، B و E  اختصاصی بوده و در سایر مناطق مشاهده نشدند. نتایج تجزیه و تحلیل شاخص تثبیت (FST) بر اساس روش دوپارامتری و آنالیز واریانس مولکولی (AMOVA) نشان داد که نمونه ­های رودخانه سفیدرود با نمونه­ های مناطق روسیه و آذربایجان اختلاف معنی­داری دارند (۰۰۱/۰ > P) و در نهایت وجود سه جمعیت شناسایی گردید. با توجه به تنوع بالای موجود در ناحیه کنترلی، توالی این ناحیه می­تواند به عنوان یک نشانگر مناسب برای شناسایی و تعیین واحدهای حفاظتی و مدیریتی ذخایر جمعیت­های احتمالی تاسماهی ایرانی به کار گرفته شود و همچنین می تواند اطلاعات ارزشمندی از کاربرد روش­های مولکولی را به منظور ژنتیک حفاظت این گونه ارائه نماید.

Authors

سجاد نظری

Shahid Motahary Cold-water Fishes Genetic and Breeding Research Center

محمد پورکاظمی

Iranian Fisheries Sciences Research Institute (IFSRI)

مجیدرضا خوش خلق

University of Guilan

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • بیک دوردی، پ. ۱۳۷۶. شناسایی پروتئین های سرم خون ماهی ...
  • پروانه، امیر. ۱۳۷۳. تعیین نژادهای مختلف تاسماهی ایرانی با استفاده ...
  • پورکاظمی،م.، ۱۳۸۷. طرح جامع ارزیابی ساختار ژنتیکی تاسماهیان دریای خزر. ...
  • توکلی، م.، پرافکنده حقیقی، ف.، خوشقلب،م.، کیمرام،ف و تقوی، الف.۱۳۸۹. ...
  • ساختار ژنتیکی و جمعیتی تاسماهی ایرانی (Acipenser persicus) سواحل جنوبی دریای خزر و رودخانه سفیدرود با استفاده از روش توالی یابی DNA [مقاله ژورنالی]
  • خوش خلق، م. ۱۳۸۵، بررسی تنوع ژنتیکی تاسماهی ایرانی و ...
  • لالویی، ف. ۱۳۷۵. بررسی چگونگی مهاجرت ماهیان خاویاری به رودخانه ...
  • عطایی، ف. ۱۳۸۱. بررسی تنوع ژنتیکی تاسماهی ایرانی (Acipenser persicus) ...
  • Avise J.C. ۱۹۹۴. Molecular Markers, Natural History, and Evolution. Chapman ...
  • Barshad G, Marom S, Cohen T, et al. ۲۰۱۸.Mitochondrial DNA ...
  • Billard, R., & Lecointre, G. ۲۰۰۱. Biology and conservation of ...
  • Excoffier L., Smouse P.E., and Quattro J.M. ۱۹۹۲. Analysis of ...
  • Felsenstein J., ۱۹۹۵. PHYLIP, Phylogeny inference package, version ۳.۵۷c. Department ...
  • Grunwald , C., Maceda , L, Waldman, J.R ., Stabile, ...
  • Khoshkholgh, M., Nazari, S., Pourkazemi, M., ۲۰۱۳. Population structure of ...
  • Khoshkholgh, M and Nazari, S., ۲۰۱۹. The genetic diversity and ...
  • Kottelat, M., Gesner, J. & Freyhof, J. ۲۰۰۹. Acipenser persicus. ...
  • Kowalchuk, G. A., F. J. de Bruijn, I. M. Head, ...
  • Kretz, K. A., and J. S. O’Brien. ۱۹۹۳. Direct sequencing ...
  • Kumar S, Tamura K. & Nei M., ۲۰۰۸ MEGA۳: integrated ...
  • Lagunova V.S. ۲۰۰۱. Natural reproduction of the Persian sturgeon (Acipenser ...
  • Liua Z.J. & J.F. Cordes. (۲۰۰۴). DNA marker technologies and ...
  • Moghim M., Kor D., Tavakolieshkalak M. & Khoshghalb M.B. (۲۰۰۶). ...
  • Moghim M., Heist E. J. Tan S. G. Pourkazemi M. ...
  • Nei, M. ۱۹۷۲. Genetic distance between population. Am. Naturalist. pp. ...
  • Nei, M., and Tajima, F., ۱۹۸۱. DNA polymorphism detectable by ...
  • Ong T.L., Stabile J., Waldman J.R. and Wirgin I., ۱۹۹۶. ...
  • Pourkazemi, M. ۱۹۹۶. Molecular and biochemical genetic analysis of sturgeon ...
  • Pourkazemi, M. ۲۰۰۶. Caspian Sea sturgeon Conservation and Fisheries: Past ...
  • Pourkazemi, M., Nazari, S., Khoshkholgh, MR., and Azizzadeh, L., ۲۰۱۲. ...
  • Putilina L.A. and E.N. Artyukhin. ۱۹۸۵. Some features of Persian ...
  • Rastorguev, S., Mugue, N., Volkov, A & Barmintsev, V. ۲۰۰۸. ...
  • Rezvani Gilkolaei, S. & Skibinski, D. O. F., ۱۹۹۹. Polymerase ...
  • Roques, S., Berrebi, P., Rochard, E., & Accolas, M., ۲۰۱۸. ...
  • Sambrook, J., Fritsch, E. F. & Maniatis, T. ۱۹۸۹. Molecular ...
  • Shedko, S.V., Miroshnichenko, I.L., Nemkova, G.A., et al. ۲۰۱۵. Mitochondrial ...
  • Shedko, S. V., ۲۰۱۹. Causes of the Excess of Frequency ...
  • Vecsei P. & Artyukhin E. ۲۰۰۱. Threatened fishes of the ...
  • Waldman, J., Alter, S.E., Peterson, D., ۲۰۱۹. Contemporary and historical ...
  • Weir B.S. & Cockerham C.C. ۱۹۸۴. Estimating F-statistics for the ...
  • White, DJ. Wolff, Pierson J N M. and Gemmell N ...
  • Wirgin I., Waldman J.R., Rosko L., Gross R., Collins M.R., ...
  • Wirgin I., Waldman J., Stabile, J., Lubinski, B. & King ...
  • Wirgin I., Grunwald C., Carlson E., Stabile J., Peterson D. ...
  • Wirgin I., Grunwald C., Stabile J., & Waldman J. ۲۰۰۹. ...
  • Wirgin I, Roy NK, Maceda L, Mattson M., ۲۰۱۸. DPS ...
  • نمایش کامل مراجع