شناسایی جهش های پایدارکننده ساختارآنزیم لوسیفراز گونه ایرانی بوسیله ابزارها و پایگاه های بیوانفورماتیک و شبیه سازی دینامیک مولکولی

   آنزیم لوسیفراز در واکنش بیولومینسانس (نشر نور توسط موجودات زنده) دخالت دارد. این آنزیم به­عنوان گزارشگر ژنی در تصویربرداری in vivo کاربردهای فراوانی دارد. علی­رغم کاربردهای فراوان و تشخیصی آنزیم لوسیفراز، چندین عامل هم­چون پایداری پایین لوسیفراز نسبت به حرارت و Km بالا برای سوبسترای ATP استفاده از آن را محدود کرده است. با توجه به پایداری پایین آنزیم لوسیفراز مطالعه حاضر جهت ارزیابی تاثیر جهش­های تک اسیدآمینه بر پایداری آنزیم لوسیفراز گونه ایرانی لامفیریس ترکستانیکوس[۱] با استفاده از وب­سرورهای بیوانفورماتیک و شبیه­سازی دینامیک مولکولی صورت گرفت. برای این منظور ابتدا جهت تعیین پایداری، جهش­ها  با استفاده از وب­سرورهای I-Mutant-۲، Pop-music، Cupsat، istable،MUpro  و ابزارهای Protparam و foldx تحت نرم­افزار Yasara بررسی شد. وب سرورها و foldx پیش­بینی کردند که دو جهش Q۳۵L و H۹M  باعث پایداری  ساختار می­شوند. وب­سرور Polyphen-۲هم پیشگویی کرد که این دو جهش در عملکرد آنزیم اثر مخرب ندارد. برای تایید بیش­تر این دو جهش شبیه­سازی دینامیک مولکولی انجام شد، که نتایج RMSD و RMSF و شعاع ژیراسیون و هیدروفوبیسیته هم نشان دادند که این جهش­ها باعث پایداری این آنزیم می­شود.    

Keywords:

لوسیفراز , جهش , پایداری , دینامیک مولکولی