مطالعه پاسخ پروتئوم برگ گیاه Aeluropus littoralis در شرایط تنش شوری

 سابقه و هدف : گیاهان هالوفیت به جهت متکامل شدن در شرایط تنش، از بهترین گزینه­های پیش رو برای توصیف مبانی مولکولی فیزیولوژی تحمل به شوری و بهنژادی گیاهان زراعی می­باشند. در همین راستا با توجه به اینکه گیاه Aeluropus littoralis یک هالوفیت تک­لپه محسوب می­شود و قرابت ژنتیکی با گندم، برنج و جو دارد، پژوهشی بمنظور بررسی الگوی کلی بیان محتوای پروتئینی برگ­های این گیاه در پاسخ به تنش شوری در چهار سطح نرمال و شوری ۱۰۰، ۲۰۰ و ۳۰۰ میلی­مولار با استفاده از تکنیک پروتئومیکس انجام گردید. مواد و روش­ها: برای بررسی اثر تنش شوری بر روی الگوی پروتئوم گیاه آلوروپوس، تیمار نمک در ۳ سطح (۱۰۰، ۲۰۰ و ۳۰۰ میلی­مولار کلرید سدیم) اعمال گردید و پس از ۲۱ روز در شرایط تنش در نهایت برگ­های بالغ و کامل واقع در منطقه میانی گیاه، جهت استخراج پروتئین برداشت شد . پروتئین­های استخراج شده در دو بعد بوسیله ژل­های IPG با شیب ۷-۴ pH: ( cm ۲۴) و ژل­های اکریل­آمید ۵/۱۲ درصد جداسازی شدند. یافته­ها: نتایج حاصل از ارزیابی آماری نشان داد، که از مجموع ۵۵۰ نقطه پروتئینی تکرار پذیر حداقل ۹۵ نقطه پروتئینی در سطوح شوری مورد مطالعه، تغییر بیان نشان دادند که این تغییرات شامل افزایش و کاهش بیان بود. همچنین بیشترین در صد پروتئین­هایی که افزایش و یا کاهش بیان نشان دادند به ترتیب در مقایسه بین تیمارهای نرمال و ۲۰۰و سطوح ۲۰۰و ۳۰۰ بدست آمد. بر اساس آنالیز کلاستر مجموعه پروتئین­های پاسخگو در ۱۰ کلاس پروتئینی هم­بیان قرار گرفت. ارزیابی کلاس­های پروتئینی مختلف، نشان داد پروتئوم پاسخ­دهنده به شوری در این گیاه از لحاظ هم­بیانی از چهار روند مشخص تبعیت می­کند.  نتیجه­گیری : نتایج این تحقیق نشان می­دهد که مطالعه میزان تغییرات بیان پروتئین­های منفرد به تنهایی راهگشا نخواهد بود بلکه شناخت مجموعه پروتئین­های هم­بیان و مطالعه الگوی تغییرات جمعی آنها در پاسخ به سطوح مختلف تنش نیز از اهمیت برخودار است و درک بهتری می دهد.

Keywords:

Proteomics , Salinity stress , ۲D-Electrophoresis , Aeluropus Littoralis , پرتئومیکس , تنش شوری , الکتروفورز دو بعدی , Aeluropus littoralis