مطالعه بیوانفورماتیکی ژن Wdhn۱۳ در گونه های دیپلوئید، تتراپلوئید و هگزاپلوئید گندم با استفاده از روش Insilco AFLP Analysis
Publish place: New Cellular Biotechnology - Molecular، Vol: 3، Issue: 11
Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 184
This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_NCMBJ-3-11_002
تاریخ نمایه سازی: 21 اسفند 1400
Abstract:
سابقه و هدف: ژن Wdhn۱۳ کد کننده پروتئین های گروه ۲ LEA می باشد. پروتئین های LEA اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. ساختار اولیه پروتئین های LEA شامل دمین های اولیه باردار و بدون بار از آمینواسید های قطبی باقی مانده اما غیرآبدوست می باشد، که دلالت برآبدوست بودن پروتئین های LEA دارد. مواد و روشها: در این تحقیق روابط فیلوژنتیکی و بیوانفورماتیکی ژن Wdhn۱۳ در ۸ گونه گندم مطالعه شد و جهت آنالیز های مولکولی ۳ آنزیم برشی: HindIII با سایت برشی aagctt، AluBI با سایت برشی agct و TaqI با سایت برشی tcga استفاده شد و توسط نرم افزار بیولوژیکی CLC به صورت Insilco و در شرایط خارج آزمایشگاهی به توالی ها اعمال شد. یافته ها: نتایج حاصل از آنالیزهای فیلوژنتیکی بر اساس الگوریتم UPGMA نشان دهنده این موضوع بود که گندم های مورد بررسی از لحاظ این ژن در۳ گروه قرار دارند.که گروه اول شامل ۴ رقم گندم نان(توالی موجود در NCBI)، گندم سرداری، گندم دوروم شوش و گندم دوروم بروجرد، گروه دوم شامل ۱رقم وحشی اورارتو و گروه سوم شامل ۲ رقم نان گنبد و دیکوکوئیدز بودند. نتیجه گیری: نتایج این تحقیق نمایانگر ارتباط ویژه و نزدیکی بعضی گونه های مورد مطالعه بود.
Keywords:
Authors
مهران فلک ناز
Agronomy and Plant Breeding Department, Ilam University, Ilam, Iran
علی اشرف مهرابی
Agronomy and Plant Breeding Department, Ilam University, Ilam, Iran
دانیال کهریزی
Agronomy and Plant Breeding Department, Razi University, Kermanshah, Iran
علی اصغر نصراله نژاد
Agronomy and Plant Breeding Department, Agricultural Sciences & Natural Resources University of Groan, Agricultural Sciences & Natural Resources University of Gorgan, Iran
خیراله یاری
Medical Biology Research Center, Kermanshah University of Medical Sciences, Kermanshah, Iran