ارزیابی تاثیر ژنتیکی باکتری «انتروکوک فکالیس» بر معده خط سلولی MKN۷۴

انتروکوک فکالیس یکی از اعضای مهم میکروبیوتای همزیست در دستگاه گوارش انسان است. در بسیاری از تحقیق ها نشان داده شده که میزان عفونت به وسیله انتروکوک فکالیس در سرطان معده به طور قابل توجهی افزایش پیدا می کند. به طور علمی ثابت شده که برخی عفونت ها طی پیشرفت سرطان توسعه پیدا می کنند، اما اینکه این عامل عفونت میزبان سودمند است (کاهش متاستاز) یا زیانبار (افزایش توسعه، هجوم، فنونیپ شبیه به سلول های بنیادی)، هنوز نامشخص است. این اطلاعات مخالف زمانی که به طور جزئی تحلیل شوند می توانند به طور قابل توجهی به فهم پیشرفت سرطان کمک کنند. اطلاعات بیان ژن از Array Express (E-MEXP- ۳۴۹۶) بازیابی شده. واریانس، آزمون t و تحلیل رگرسیون خطی، دسته بندی سلسله مراتبی، شبکه و تجزیه و تحلیل مسیر انجام شد. در این مطالعه، ما ژن های تغییر پیدا کرده ی درگیر در عفونت انتروکوک فکالیس در رده ی سلولی MKN۷۴ و مسیرهای مربوطه را برای متوجه شدن اینکه آیا عفونت باعث کند. شدن پیشرفت سرطان می شود یا نه، شناسایی کردیم. دوازده ژن مطابق با پانزده مجموعه تحقیق پیرو عفونت زنده سلول های سرطاانی معده با انترکوک فکالیسم تنظیم شدند. ما شبکه ی ارتباطی ای بین این ژن ها و مسیرهای مربوط به آنها شناسایی کردیم. تحلیل مسیر نشان داد که این ژن ها بیشتر با افزایش سلول های سرطانی مرتبط هستند. مشخص شد که ژن های NDC۸۰, NCAPG, CENPA, KIF۲۳, BUB۱B, BUB۱, CASC۵, KIF۲C, CENPF, SPC۲۵، SMC۴، KIF۲۰A با اتوژن (عاملی بیماری زا) های سرطان معده مرتبط هستند. تقریبا همه این ژن ها در تکثیر سلول های سرطانی موثر هستند. مخصوصا در مرحله ی سرایت بیماری. به همین دلیل فرض براین است که کاهش این ژن ها ممکن است باعث تاثیر بر کاهش تکثیر سلول های پاتوژن های سرطان معده بشود. پیش بینی شده که سرایت باکتری انتروکوک فکالیس ممکن است یک عامل مهم برای سرطان معده باشد.

Keywords:

سرطان معده , عفونت باکتری انترکوک فکالیس , ای - فکالیس , توسعه , اختصارهای چرخه ی سلولی , گونه های فعال واکنش پذیراکسیژن , پروژه ژنوم سرطان CPG , پایگاه داده ی DAVID برای حاشیه نویسی , تصویرسازی و یافته ی جامع , تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه ژن , امتیازغنی سازی ES , امتیاز غنی سازی عادی NES , ارزش اسمی p (NOM p value) , میزان نرخ کشف نادرست q