واکاوی مولکولی برخی نژادگان های انبه جنوب ایران براساس ناحیه بین ژنی trnH-psbA

انبه یکی از مهمترین میوه های قاره آسیا و مناطق گرمسیر و نیمه گرمسیر دنیاست. در پژوهش حاضر تنوع ژنتیکی درون گونه ای ۳۰ نژادگان انبه از برخی مناطق دو استان جنوب کشور، کرمان و هرمزگان (رودان، منوجان، فاریاب، جیرفت، عنبرآباد، هیشین، دهکهان و بلوک) از راه ارزیابی ناحیه بین ژنی trnH-psbA کلروپلاست مورد بررسی قرار گرفت. پس از نمونه برداری از برگ های جوان، استخراج DNA و PCR با استفاده از آغازگرهای ژن trnH-psbA(IGS)  انجام شد. محصولات تکثیر شده مربوط به هر یک از نژادگان های مورد مطالعه، پس از تعیین توالی در پایگاه داده NCBI ثبت شدند. واکاوی ها و ترسیم دندروگرام روابط فیلوژنتیک و ماتریس تشابه توالی ها با نرم افزارهای Darwin، Popgene و Mega انجام شد تا روابط خویشاوندی و فاصله ژنتیکی بین نژادگان ها تعیین شود. تجزیه توالی ها نشان داد که در ناحیه بین ژنی trnH-psbA در مجموع ۳۶۱ جایگاه شناسایی شد. بررسی شباهت توالی نمونه های انبه مورد بررسی با یکدیگر نشانگر یک توالی مشترک ۱۱۶ جفت بازی در میان آن ها بود. براساس دندوگرام حاصل از تجزیه خوشه ای، نژادگان ها در چهار گروه مختلف قرار گرفتند. بر اساس نتیجه های حاصل می توان نتیجه گرفت که استفاده از ناحیه بین ژنی trnH-psbA برای مطالعه و شناخت تنوع و روابط درون گونه ای انبه مفید بوده است.

Keywords:

Mango , Intraspecific genetic variation , DNA barcoding , Phylogenetic relationships , Chloroplast markers , انبه , تنوع ژنتیکی درون گونه ای , DNA بارکدینگ , روابط فیلوژنتیک , نشانگر کلروپلاستی