مقایسه اثر ضد ویروسی پپتید لاکتوفرین شتری (CLF۳۶) و داروهای نسل جدید بر علیه ویروس هپاتیت C
Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 14، Issue: 2
Publish Year: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 129
This Paper With 24 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JOAGK-14-2_002
تاریخ نمایه سازی: 2 خرداد 1401
Abstract:
هدف: عفونت هپاتیت C یکی از شایع ترین بیماریهای عفونی مزمن در جهان میباشد و سالانه حدود ۳ تا ۵ میلیون نفر به این عفونت مبتلا میگردند. متاسفانه با وجود پیشرفتهای اخیر، هنوز هم مشکلات گستردهای برای درمان این افراد وجود دارد و بسیاری از نیازها برآورده نشده است. در نتیجه نیاز مبرمی به استراتژیهای درمانی موثرتری برای درمان این بیماری میباشد. یکی از این رویکردهای درمانی جدید، استفاده از پروتئینهای نوترکیب است، که هیچ گونه اثرات جانبی برای بیمار نداشته و در عین حال نیز ارزان و قابل دسترس میباشد. در نتیجه هدف از انجام این مطالعه، بررسی اثر ضد ویروسی پپتید نوترکیب CLF۳۶ مشتق شده از لاکتوفرین شتری بر علیه ویروس هپاتیت C در شرایط برون تنی میباشد. مواد و روش ها: در این مطالعه، ساختارهای سهبعدی پروتئازهای ویروس هپاتیت C (NS۲, NS۳, NS۴A, NS۵A و NS۵B) و پپتید نوترکیب CLF۳۶، تهیه شد. ساختار شیمیایی داروهای ضد ویروسی نیز از پایگاه PubChem دانلود شد. به منظور بررسی پایداری ساختارهای پیشبینی شده، شبیه سازی دینامیک مولکولی با استفاده از نرم افزار GROMACS نسخه ۲۰۱۹ و در مدت زمان ۱۰۰ نانوثانیه انجام شد. سپس به منظور بررسی خاصیت ضد ویروسی پپتید، داکینگ مولکولی برای پپتید و داروها در شرایط استاتیک و با استفاده از نرم افزارهای Cluspro و HADDOCK انجام شد. به منظور بررسی پایداری کمپلکسها، کمپلکسهای با مقادیر منفیتر انرژی آزاد اتصال، جهت انجام شبیه سازی دینامیک مولکولی انتخاب شدند. در نهایت نتایج به دست آمده، در شرایط دینامیکی در نرم افزار گرومکس مورد بررسی قرار گرفت. سپس پپتیدهای مهندسی شده با توجه به نتایج طراحی شدند و توالی بهترین پپتید مهندسی شده جهت سنتز ارسال شد. پس از انجام کلون و بیان پپتید نوترکیب در میزبان مخمری، میزان IC۵۰ پپتید بر روی رده سلول کبد Huh۷/۵ مشخص شد و سلولهای آلوده به ویروس با پپتید مورد نظر تیمار شدند و پس از استخراج RNA از سلولها، لود ویروس در نمونهها با استفاده از روش Real time PCR سنجیده شد. نتایج: از بین نتایج بهدست آمده از داکینگهای مختلف انجام شده بین پروتئازهای ویروس و پپتید نوترکیب و داروهای تجاری، مشخص شد که قدرت اتصال پپتید (به طور میانگین ۹۲/۹۹-) در مقایسه با سایر داروها (به طور میانگین ۵۴/۶۱-) بسیار بیشتر میباشد و این امر بیانگر خاصیت ضد ویروسی بالای پپتید نوترکیب است. نتایج به دست آمده از دینامیک مولکولی نشان داد که مقادیر RMSD و پیوندهای هیدروژنی و انرژی اتصال، برای پپتید CLF۳۶ متصل به پروتئازهای ویروس در مقایسه با سایر داروها، حاکی از اتصال قویتر این پپتید میباشد. علاوه بر این، پپتید مهندسی شده نیز در مقایسه با پپتد طبیعی، فعالیت ضد ویروسی قوی تری را نشان داد (انرژی اتصال ۸ واحد قوی تر بود). بررسی عملکرد پپتید در شرایط آزمایشگاهی نیز نشان داد که این پپتید در مقایسه با داروها اثر ضد ویروسی قوی تری دارد به صورتی که توانسته بود به طور کامل از تکثیر ویروس در سلولها جلوگیری کند. نتیجه گیری: نتایج نهایی به دست آمده از این مطالعه، بیانگر این بود که پپتید نوترکیب مهندسی شده، خاصیت ضد ویروسی قوی دارد. هرچند که برای تایید این نتایج، نیاز به انجام مطالعات آزمایشگاهی تکمیلی میباشد.
Keywords:
Authors
مرجان ازغندی
دانشجوی دکترا، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران.
مجتبی طهمورث پور
مشهد - دانشگاه فردوسی مشهد - گروه علوم دام
محمد هادی سخاوتی
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :