Tripeptide arginyl-glycyl-aspartic acid (RGD) for delivery of Cyclophosphamide anticancer drug: A computational approach

Publish Year: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: English
View: 117

This Paper With 25 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJND-11-4_002

تاریخ نمایه سازی: 17 خرداد 1401

Abstract:

Density functional theory (DFT) calculations were performed on tripeptide arginyl-glycyl-aspartic acid (RGD) as an efficient drug carrier to deliver the commercially famous cyclophosphamide (CP) anticancer drug within ethanol solution. The most negative binding energy (-۵.۲۲ kcal/mol) was measured for the CP-RGD-۷ created through the H-bond interaction between the P=O (phosphoryl) oxygen atom of the CP and hydrogen atom of O-H group in the RGD. The quantum theory of atoms in molecules (QTAIM) proved that the CP-RGD-۶ was composed of five intra-molecular CH…HC, N…HC and NH…OC plus one inter-molecular NH…N interactions. Among CP-RGD-۶, CP-RGD-۷ and CP-RGD-۸ with the smallest binding energies (highest structural stabilities), the CP-RGD-۶ showed the minimum hardness, energy gap and chemical potential whereas the utmost electrophilicity index and electronegativity which confirmed it could the most effectively be bound onto the cancer cells. Consequently, among twenty designed carriers, the CP-RGD-۶ was recognized as the most promising drug delivery system. According to the results achieved from the molecular dynamics (MD) simulations performed in ethanol solvent on the CP-RGD-PEG systems containing different number of PEG chains, it was established that the CP-RGD-۶PEG cell was the most suitable vehicle with desirable FV (۴۹۸۸.۸۹ Å۳) and FFV (۲۲.۶۶%) values as well as small drug diffusion coefficient (۰.۰۱۱۴×۱۰–۵ cm۲/s) indicating low drug release rate.

Authors

Zahra Nikfar

Department of Chemistry, Amirkabir University of Technology (Tehran Polytechnic), P.O.Box:۱۵۸۷۵-۴۴۱۳, Tehran, Iran.

Zahra Shariatinia

Department of Chemistry, Amirkabir University of Technology (Tehran Polytechnic), P.O.Box:۱۵۸۷۵-۴۴۱۳, Tehran, Iran.

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Tian B., Liu Y., Liu J., (۲۰۲۰), Cyclodextrin as a ...
  • Ahmadi R., Ebrahimzadeh M. A., (۲۰۲۰), Resveratrol–A comprehensive review of ...
  • Adebayo-Tayo B. C., Inem S. A., Olaniyi O. A., (۲۰۱۹), ...
  • Saadatmand M. M., Yazdanshenas M. E., Khajavi R., Mighani F., ...
  • Verma P., Maheshwari S. K., (۲۰۱۹), Applications of Silver nanoparticles ...
  • Ghavidel M., Shirazi Beheshtiha S. Y., Heravi M., (۲۰۱۸), Cu(I) ...
  • Ahmadi R., Jalali Sarvestani M. R., Sadeghi B., (۲۰۱۸), Computational ...
  • Mirzaei M., (۲۰۱۳), Effects of carbon nanotubes on properties of ...
  • Gao F., Sun Z., Kong F., Xiao J., (۲۰۲۰), Artemisinin-derived ...
  • Shariatinia Z., (۲۰۱۹), Pharmaceutical applications of chitosan. Adv. Colloid Interface ...
  • Shariatinia Z., (۲۰۱۸), Carboxymethyl chitosan: Properties and biomedical applications. Int. ...
  • Shariatinia Z., Fazli M., (۲۰۱۵), Mechanical properties and antibacterial activities ...
  • Shariatinia Z., Jalali A. M., (۲۰۱۸), Chitosan-based hydrogels: Preparation, properties ...
  • Shariatinia Z., Mazloom-Jalali A., (۲۰۱۹), Chitosan nanocomposite drug delivery systems ...
  • Mazloom-Jalali A., Shariatinia Z., Tamai I. A., Pakzad S.-R., Malakootikhah ...
  • Shariatinia Z., Barzegari A., (۲۰۱۹), Chapter ۲۲-Polysaccharide hydrogel films/membranes for ...
  • Shariatinia Z., Mohammadi-Denyani A., (۲۰۱۸), Advances in polymers for drug ...
  • Shariatinia Z., Nikfar Z., Gholivand K., Abolghasemi Tarei S., (۲۰۱۵), ...
  • Shariatinia Z., Zahraee Z., (۲۰۱۷), Controlled release of metformin from ...
  • Vatanparast M., Shariatinia Z., (۲۰۱۹), Revealing the role of different ...
  • Fazli Y., Shariatinia Z., Kohsari I., Azadmehr A., Pourmortazavi S. ...
  • Kohsari I., Shariatinia Z., Pourmortazavi S. M., (۲۰۱۶), Antibacterial electrospun ...
  • Kohsari I., Shariatinia Z., Pourmortazavi S. M., (۲۰۱۶), Antibacterial electrospun ...
  • Fazli Y., Shariatinia Z., (۲۰۱۷), Controlled release of cefazolin sodium ...
  • Nikfar Z., Shariatinia Z., (۲۰۱۹), The RGD tripeptide anticancer drug ...
  • Shariatinia Z., (۲۰۲۰), Biopolymeric nanocomposites in drug delivery. In: Advanced ...
  • Shariatinia Z., (۲۰۱۹), Chapter ۲-Pharmaceutical applications of natural polysaccharides. In: ...
  • Shariatinia Z., Fasihozaman-Langroodi K., (۲۰۱۹), Chapter ۸-Biodegradable Polymer Nanobiocomposite Packaging ...
  • Kohsari I., Mohammad-Zadeh M., Minaeian S., Rezaee M., Barzegari A., ...
  • Faramarzi R., Falahati M., Mirzaei M., (۲۰۲۰), Interactions of fluorouracil ...
  • Mirzaei M., (۲۰۱۳), Formation of a peptide assisted bi-graphene and ...
  • Mirzaei M., Hadipour N. L., (۲۰۰۸), Study of hydrogen bonds ...
  • Mirzaei M., Meskinfam M., Yousefi M., (۲۰۱۲), Covalent hybridizations of ...
  • Mirzaei M., Samadi Z., Hadipour N. L., (۲۰۱۰), Hydrogen bonds ...
  • Xu Y., Zhang X., Wang N., Pei X., Guo Y., ...
  • Kang Z., Ding G., Meng Z., Meng Q., (۲۰۱۹), The ...
  • Xu J., Khan A. R., Fu M., Wang R., Ji ...
  • Zhang L., Li G., Gao M., Liu X., Ji B., ...
  • Wang G., Wang Z., Li C., Duan G., Wang K., ...
  • Guo Y.-N., Lu X., Weng J., Leng Y., (۲۰۱۳), Density ...
  • Muir J. M. R., Costa D., Idriss H., (۲۰۱۴), DFT ...
  • Uemura Y., Taniike T., Tada M., Morikawa Y., Iwasawa Y., ...
  • Shariatinia Z., Shahidi S., (۲۰۱۴), A DFT study on the ...
  • Nikfar Z., Shariatinia Z., (۲۰۱۷), Phosphate functionalized (۴, ۴)-armchair CNTs ...
  • Nikfar Z., Shariatinia Z., (۲۰۱۷), DFT computational study on the ...
  • Shariatinia Z., Nikfar Z., (۲۰۱۳), Synthesis and antibacterial activities of ...
  • Shariatinia Z., Mazloom-Jalali A., (۲۰۲۰), Molecular dynamics simulations on chitosan/graphene ...
  • Shariatinia Z., (۲۰۱۸), Bonding of phosphoramides onto B-C۵۹ nanostructure as ...
  • Vatanparast M., Shariatinia Z., (۲۰۱۹), Hexagonal boron nitride nanosheet as ...
  • Vatanparast M., Shariatinia Z., (۲۰۱۸), Computational studies on the doped ...
  • Vatanparast M., Shariatinia Z., (۲۰۱۸), AlN and AlP doped graphene ...
  • Mazloom-Jalali A., Shariatinia Z., (۲۰۲۰), Molecular dynamics simulations on polymeric ...
  • Mazloom-Jalali A., Shariatinia Z., (۲۰۱۹), Polycaprolactone nanocomposite systems used to ...
  • Jalali A. M., Shariatinia Z., Taromi F. A., (۲۰۱۷), Desulfurization ...
  • Shariatinia Z., Jalali A. M., Taromi F. A., (۲۰۱۶), Molecular ...
  • Gaussian ۰۹, Revision A.۰۲, Frisch M. J., Trucks G. W., ...
  • Accelrys Software Inc. San Diego, ۲۰۰۹ ...
  • Ghosh P., Bag S., Roy A. S., Subramani E., Chaudhury ...
  • Sun S., Xiao Q.-R., Wang Y., Jiang Y., (۲۰۱۸), Roles ...
  • Shariatinia Z., Della Védova C. O., Erben M. F., Tavasolinasab ...
  • Shariatinia Z., Mousavi H. S. M., Bereciartua P. J., Dusek ...
  • Shariatinia Z., Dusek M., Eigner V., (۲۰۱۴), Synthesis, X‐ray crystallography, ...
  • Shariatinia Z., Asadi E., Yousefi M., Sohrabi M., (۲۰۱۲), Novel ...
  • Shariatinia Z., Moghadam E. J., Maghsoudi N., Mousavi H. S. ...
  • Suma N., Aruldhas D., Joe I. H., Anuf A. R., ...
  • Mulliken R. S., (۱۹۳۴), A new electroaffinity scale; together with ...
  • نمایش کامل مراجع