مطالعه تنوع و ذخایر ژنتیکی قوچ و میش ارمنی (Ovis orientalis) در شمال غربی ایران با استفاده از تراشه های میکروآرای DNA و توالی کامل ژنوم

Publish Year: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 145

This Paper With 9 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_AEJO-13-4_003

تاریخ نمایه سازی: 5 تیر 1401

Abstract:

قوچ و میش ­های ارمنی (Ovis orientalis) غرب ایران به دلایلی از جمله شکار غیرمجاز و تخریب زیستگاه در فهرست سرخ IUCN  در رده آسیب پذیر قرار گرفته و از سویی به عنوان نیای اجدادی نژادهای اهلی گوسفند (Ovis aries) سراسر دنیا ارزش فراملی دارند. در این مطالعه با استفاده از توالی یابی کل ژنوم و چیپ های BeadChip Ovine SNP ۵۰K تنوع و ذخایر ژنتیکی جمعیت­ های قوچ و میش ارمنی شمال غرب ایران (آذربایجان غربی و شرقی، کردستان، مرکزی، همدان، قزوین) به عنوان خاستگاه اهلی سازی گوسفند، شناسایی و با گوسفند­های اهلی همان مناطق مقایسه شد. تعداد SNP های کل ژنوم، ضریب درون آمیزی و ژنتیک لود بر اساس داده  ­های ژنوم کامل، هم چنین هتروزیگوسیتی مورد انتظار به عنوان پارامترهای مرتبط با تنوع ژنتیکی بین دو گروه اهلی و وحشی مقایسه شدند. براساس نتایج به دست آمده تعداد SNP های تفکیک کننده به عنوان مهم ترین پارامتر تقریبا ۲۴ میلیون برای گروه وحشی­ و در حدود ۲۰ میلیون برای گروه اهلی­ محاسبه شد که اختلاف چشمگیری را نشان داد. با توجه به یافته­ های تنوع نوکلئوتیدی ژنوم، تنوع ژنتیکی بر اساس داده­ های ژنوم کامل در گروه وحشی نسبت به گروه اهلی بیش تر بود. بر اساس نتایج مطالعه حاضر قوچ و میش ارمنی با داشتن میزان بالای تنوع ژنتیکی به عنوان ذخایر ژنتیکی برای نژادهای اهلی تمامی گوسفندان اهلی دنیا ارزش حیاتی دارند و باید در اولویت برنامه های حفاظتی قرار بگیرند.

Keywords:

قوچ و میش ارمنی , تنوع ژنتیکی , ذخایر ژنتیکی , Ovis

Authors

وحید زمانی

گروه محیط زیست، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران

مرضیه اسدی آق بلاغی

گروه تنوع زیستی و مدیریت اکوسیستم ها، پژوهشکده علوم محیطی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران

سعید نادری

گروه محیط زیست، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران

حمیدرضا رضایی

گروه محیط زیست، دانشکده شیلات و محیط زیست، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Karami, P. and Shayesteh, K., ۲۰۱۸. Investigation of ecological niche of ...
  • Peters, J.; von den Dreisch, A. and Helmer, D. ۲۰۰۵. ...
  • Rezaei, H., ۲۰۰۷. Phylogénie moléculaire du Genre Ovis (Mouton et ...
  • Zeder, M.A., ۲۰۰۸. Domestication and early agriculture in the Mediterranean ...
  • IUCN (International Union for Conservation of Nature). ۲۰۱۸. The IUCN ...
  • Ashrafzadeh, M.R.; Naghipour, A.A.; Haidarian, M. and Mirzaei, R., ۲۰۲۰. ...
  • Asadi Aghbolaghi, M.; Ahmadzadeh, Kiabi, B. and Keyghobadi, N., ۲۰۲۰. ...
  • Linda, K.P. and Paul, M., ۱۹۹۵. Developments in molecular genetic ...
  • Wolf, A.B.; Caselli, R.J.; Reiman, E.M. and Valla, J., ۲۰۱۳. ...
  • Nachman, M.W., ۲۰۰۱. Single nucleotide polymorphisms and recombination rate in ...
  • Naderi, S.; Rezaei, H.R.; Taberlet, P.; Zundel, S.; Rafat, S.A.; ...
  • Morin, P.A.; Luikart, G. and Wayne, R.K., ۲۰۰۴. SNPs in ...
  • Jehle, R. and Arntzen, J.W., ۲۰۰۲. Microsatellite markers in amphibian ...
  • Aulchenko, Y.S.; Ripke, S.; Isaacs, A. and Van Duijn, C.M., ...
  • Purcell, S.; Neale, B.; Todd-Brown, K.; Thomas, L.; Ferreira, M.A.; ...
  • Danecek, P.; Auton, A.; Abecasis, G.; Albers, C.A.; Banks, E.; ...
  • Librado, P.; Gamba, C.; Gaunitz, C.; Der Sarkissian, C.; Pruvost, ...
  • Bertorelle, G.; Bruford, M.W.; Hauffe, H.C.; Rizzoli, A. and Vernesi, ...
  • Freeland, J.R., ۲۰۲۰. Molecular ecology. John Wiley & Sons ...
  • Pichler, R.; Hussain, T.; Xu, W.; Aftab, A.; Babar, M.E.; ...
  • نمایش کامل مراجع