انتقال پذیری و چندشکلی نشانگرهای ریزماهواره جو در ارزیابی روابط فیلوژنتیک جنس های تریتیکوم (Triticum) و هوردئوم (Hordeum)
Publish place: Iranian Journal of Crop Sciences، Vol: 18، Issue: 2
Publish Year: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 261
This Paper With 16 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_AGRO-18-2_002
تاریخ نمایه سازی: 24 تیر 1401
Abstract:
جنسهای تریتیکوم و هوردئوم، دو جنس از طایفه تریتیسه (Triticeae) با گونههای زراعی مهم میباشند. ارزیابی روابط فیلوژنتیک گونههای زراعی و خویشاوندان وحشی این جنسها برای استفاده بهینه از آنها در برنامههای اصلاحی ضروری است. در این آزمایش روابط فیلوژنتیک چهار گونه از جنس تریتیکوم و سه گونه از جنس هوردئوم با استفاده از ۱۵۰ جفت آغازگر ریزماهواره جو مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج نشان داد که در مجموع ۴۹ جفت آغازگر در هر دو جنس و ۱۹ جفت آغازگر فقط در جنس هوردئوم تکثیر شدند. از بین نشانگرهای تکثیر شده، ۲۱ نشانگر در گونههای جنس تریتیکوم چند شکل بودند که در مجموع ۵۹ آلل با دامنه آللی ۲ تا ۵ و میانگین ۸۰/۲ آلل به ازای هر جایگاه، تکثیر شدند. در جنس هوردئوم نیز با استفاده ۴۳ نشانگر چندشکل، ۱۲۳ آلل با میانگین ۰۲/۳ آلل ودامنه تغییرات ۲ تا ۱۴ بدست آمد. در مجموع در گونههای دو جنس، با استفاده
از ۱۸ جفت آغازگر چندشکل، ۹۱ آلل با دامنه تغییرات ۲ تا ۱۹ و میانگین ۰۵/۵ آلل به ازای هر جایگاه تکثیر شدند و تنوع ژنی از ۱۴/۰ تا ۸۵/۰ با میانگین ۵۹/۰ متغیر بود. بر اساس تجزیه خوشهای با استفاده از الگوریتم Neighbor-Joining و ضریب فاصله Kimura-۲-Parameters و نیز تجزیه به بردارهای اصلی براساس دادههای ریزماهواره، گونههای مربوط به دو جنس کاملا از یکدیگر تفکیک شدند. در خوشه جنس تریتیکوم، چهار گونه براساس سطح پلوئیدی در زیر خوشههای جداگانه گروهبندی شدند، به طوری که ارقام زراعی گندم نان کاملا از خویشاوندان وحشی آن تفکیک و گونههایی با ژنوم A نیز تقریبا در کنار هم واقع شدند. در گروه جنس هوردئوم نیز ارقام زراعی جو از سه خویشاوند وحشی آن تفکیک شدند. نتایج آزمایش حاضر نشاندهنده کارآیی نشانگرهای ریزماهواره جو در تجزیه روابط فیلوژنتیک جنسهای تریتیکوم و هوردئوم بود. نشانگرهای مورد استفاده علاوه بر انتقالپذیری و چند شکلی قابل قبول در گونههای دو جنس یاد شده، آنها را براساس ساختار ژنومی و روابط تکاملی تفکیک کردند.
Keywords:
Barley , Genetic diversity , SSR markers , Transferability and Wheat. , انتقال پذیری , تنوع ژنتیکی , جو , گندم و نشانگرهای SSR
Authors
خاطره علیپور
شدانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز
سید ابوالقاسم محمدی
دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز
محمد مقدم
دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز
بهزاد صادق زاده
موسسه تحقیقات دیم کشور
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :