بررسی برخی خصوصیات مولکولی جدایه های ایرانی ویروس برگ قاشقی سیب زمینی
عنوان مقاله: بررسی برخی خصوصیات مولکولی جدایه های ایرانی ویروس برگ قاشقی سیب زمینی
شناسه ملی مقاله: JR_PLNTI-4-3_001
منتشر شده در در سال 1394
شناسه ملی مقاله: JR_PLNTI-4-3_001
منتشر شده در در سال 1394
مشخصات نویسندگان مقاله:
رضا پوررحیم - بخش تحقیقات ویروس شناسی گیاهی، موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران
شیرین فرزاد فر - بخش تحقیقات ویروس شناسی گیاهی، موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران
خلاصه مقاله:
رضا پوررحیم - بخش تحقیقات ویروس شناسی گیاهی، موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران
شیرین فرزاد فر - بخش تحقیقات ویروس شناسی گیاهی، موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران
ویروس برگ قاشقی سیبزمینی (Potato leafroll virus-PLRV) عضو جنس Polerovirus، از مهمترین ویروسهای بیمارگر سیبزمینی است که از غالب مزارع سیب زمینی کشور گزارش شده است. در این پژوهش، خصوصیات مولکولی جدایههای ایرانی، با استفاده از ژن پروتئین پوششی مورد بررسی قرار گرفت. برای این منظور از مناطق مهم کشت سیبزمینی در استان های آذربایجان، اردبیل، اصفهان، خراسان و همدان بازدید و نمونه برداری به دو صورت تصادفی و انتخابی انجام شد. نمونه ها از نظر آلودگی به PLRV با استفاده از آنتی بادی اختصاصی و به روش DAS-ELISA مورد آزمون قرار گرفتند. بر اساس نتایج آزمون الایزا این ویروس در تمام استانهای مورد نظر با میانگین فراوانی آلودگی ۶/۹ درصد ردیابی گردید. بیشترین و کمترین درصد آلودگی به ترتیب در استان اصفهان (۷/۲۳ درصد) و استان اردبیل (۹/۳) تعیین شد. در این تحقیق تعداد ۱۰ جدایه ایرانی PLRV از پنج استان مورد بررسی انتخاب شده و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی، ناحیه ژنومی ORF۰ این جدایه ها طی واکنش زنجیره ای پلیمراز تکثیر گردید. همردیفی توالی نوکلئوتیدی ژن ORF۰ مربوط به ۱۰ جدایه ایرانی PLRV بهدست آمده در این تحقیق و ۲۳ توالی ORF۰ دیگر جدایه های PLRV از سایر مناطق دنیا، نشان دهنده وجود ۲/۹۴ تا ۱۰۰ درصد همسانی در بین آنها بود. این مقایسه نشان داد که در بین جدایه های ایرانی، دو جدایه Ar۵۳ و Kh۱۱۶ دارای بیشترین درصد همسانی با جدایه ای از کشور هلند (Y۰۷۴۹۶) بودند. بر اساس مطالعات تبارزایی، جدایههای PLRV به سه گروه تقسیم شدند که جدایههای ایرانی به همراه برخی از جدایههای اروپایی در گروه یک (Group I) قرار گرفتند
کلمات کلیدی: : ویروس برگ قاشقی سیب زمینی, ایران, پراکنش, تعیین توالی, ORF۰
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1485886/