مطالعه ی کل ژنوم بلدرچین ژاپنی با استفاده از رویکرد تک مرحله ای صفات مرتبط با بازده مصرف خوراک
عنوان مقاله: مطالعه ی کل ژنوم بلدرچین ژاپنی با استفاده از رویکرد تک مرحله ای صفات مرتبط با بازده مصرف خوراک
شناسه ملی مقاله: JR_JAP-24-2_001
منتشر شده در در سال 1401
شناسه ملی مقاله: JR_JAP-24-2_001
منتشر شده در در سال 1401
مشخصات نویسندگان مقاله:
حسین محمدی - استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، دانشگاه اراک.
امیر حسین خلت آبادی فراهانی - دانشیار،گروه علومدامی،دانشکده کشاورزی و محیط زیست،دانشگاه اراک،اراک،ایران.
محمد حسین مرادی - دانشیار،گروه علومدامی،دانشکده کشاورزی و محیط زیست،دانشگاه اراک،اراک،ایران.
خلاصه مقاله:
حسین محمدی - استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، دانشگاه اراک.
امیر حسین خلت آبادی فراهانی - دانشیار،گروه علومدامی،دانشکده کشاورزی و محیط زیست،دانشگاه اراک،اراک،ایران.
محمد حسین مرادی - دانشیار،گروه علومدامی،دانشکده کشاورزی و محیط زیست،دانشگاه اراک،اراک،ایران.
هدف از این مطالعه بررسی معماری ژنتیکی، شناسایی مناطق ژنومی و ژنهای کاندیدای مرتبط با صفات افزایش وزن بدن، میزان خوراک مصرفی و ضریب تبدیل خوراک در بلدرچین ژاپنی بود. برای شناسایی پنجرههای ژنومی اصلی، از روش مطالعه پویش کل ژنومی تک مرحلهای و از اطلاعات ژنومی ۹۲۰ قطعه بلدرچین ژاپنی استفاده شد. آنالیز پویش ژنومی بهوسیله نرمافزارهای خانواده BLUPF۹۰ انجام شد. نتایج براساس مقدار واریانس ژنتیکی افزایشی کنترل شده در قالب پنجرههای بهطور میانگین ۱/۵ مگابازی از SNPهای مجاور ارائه شد. پنجرههایی که بیش از یک درصد واریانس را کنترل میکردند به عنوان مناطق ژنومی موثر و برای یافتن ژنهای کاندیدا استفاده شدند. تعداد ۱۳ پنجره ژنومی معنیدار روی هشت کروموزوم، ۲۳ درصد کل واریانس ژنتیکی صفت افزایش وزن بدن را توجیه میکردند و حاوی ژنهای کاندیدای SMYD۱، ADGRG۶وCFL۲بودند. بیش ترین واریانس مربوط به پنجرهای روی کروموزوم شماره دو بود. تعداد ۲۰ پنجره روی هشت کروموزوم و شامل ژنهای کاندیدای ACSL۱،PPA۲ ، FGF۲ و RBL۲مرتبط با میزان خوراک مصرفی بودند. این پنجرهها ۳۸ درصد واریانس ژنتیکی را کنترل میکردند و مهمترین پنجره روی کروموزوم شماره چهار بود. هم چنین برای ضریب تبدیل خوراک تعداد ۱۲ منطقه ژنومی روی هفت کروموزوم، ۲۳/۷درصد از واریانس ژنتیکی را توجیه میکردند و حاوی ژنهای کاندیدای ATRNL۱و PTPN۴بود. نتایج نشان داد چهار منطقه ژنومی اثر پلیوتروپی دارند. باتوجه به شناسایی مناطق ژنومی جدیدونقش کلیدی ژنهای ذکرشده مرتبط با مصرف خوراک میتوان کارایی روش تک مرحله ای برای پویش ژنومی صفات بازده مصرف خوراک را تاییدکرد.
کلمات کلیدی: بلدرچین ژاپنی, رویکرد تک مرحله ای, ژن کاندیدا, ضریب تبدیل خوراک, وزن بدن
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1495688/