CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

شناسایی و غربالگری باکتری های تولیدکننده آنزیم لیپاز و آنالیزهای بیوانفورماتیکی

عنوان مقاله: شناسایی و غربالگری باکتری های تولیدکننده آنزیم لیپاز و آنالیزهای بیوانفورماتیکی
شناسه ملی مقاله: JR_SBSB-6-2_002
منتشر شده در در سال 1399
مشخصات نویسندگان مقاله:

اعظم مختارآبادی - دانشجوی کارشناسی ارشد بیوشیمی، گروه بیوتکنولوژی، پژوهشکده علوم محیطی، پژوهشگاه علوم و تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری های پیشرفته، کرمان، ایران
مجتبی مرتضوی - استادیار گروه بیوتکنولوژی، پژوهشکده علوم محیطی، پژوهشگاه علوم و تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری های پیشرفته، کرمان، ایران
مسعود ترک زاده ماهانی - دانشیار گروه بیوتکنولوژی، پژوهشکده علوم محیطی، پژوهشگاه علوم و تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری های پیشرفته، کرمان، ایران

خلاصه مقاله:
آنزیم لیپاز (تری آسیل گلیسرول آسیل هیدرولاز EC: ۳.۱.۱.۳) در گروه هیدرولازها طبقه بندی می شود. این آنزیم حفاظت شده متعلق به خانواده استرازها می باشد؛ که موجب هیدرولیز استرها می شود و تری آسیل گلیسرول را به گلیسرول و اسیدهای چرب هیدرولیز می کند. آنزیم لیپاز یکی از پرکاربردترین آنزیم ها در صنایع مختلف ازجمله صنایع شوینده، داروسازی، آرایشی، غذایی و کاغذ می باشد. به دلیل مشکلات فرایندهای صنعتی، انجام تحقیقات در زمینه یافتن باکتری های تولیدکننده آنزیم های دارای فعالیت بهینه در دامنه های مختلف دمایی و pH و غلظت های نمکی متفاوت حائز اهمیت می باشد. در این تحقیق نمونه هایی از منطقه چشمه آب گرم سیرچ جمع آوری شد. در ادامه جهت شناسایی گونه جداسازی شده از روش توالی یابی ژن ۱۶srRNA استفاده شد. در مرحله بعد به منظور شناسایی گونه موردنظر از پایگاه اطلاعاتی BLASTn استفاده شد. در ادامه با توجه به بلاست انجام شده، نزدیک ترین توالی ژنی آنزیم لیپاز از سایت NCBI انتخاب شد و ادامه مطالعات بیوانفورماتیکی بر روی آن انجام شد. جهت بررسی ساختارهای دوم و سوم آنزیم لیپاز از پایگاه اطلاعاتی PSIPRED استفاده شد. از سرور BIBI جهت رسم درخت فیلوژنیک و از پایگاه اطلاعاتی PROTPARAM جهت بررسی درصد آمینواسیدهای حاضر در توالی استفاده شد. در این مطالعه همچنین از پایگاه های اطلاعاتی SOPMA, TMHMM, I-TASSER و CLUSTALW جهت آنالیزهای بیوانفورماتیکی آنزیم لیپاز استفاده شده است.

کلمات کلیدی:
آنزیم لیپاز، ژن ۱۶srRNA، درخت فیلوژنیک، BIBI Database، آنالیز بیوانفورماتیک

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1502491/