ردیابی ویروئیدهای مرکبات با روش استخراج اسید نوکلئیک توسط CF-۱۱

Publish Year: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 125

This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JAEN-85-1_008

تاریخ نمایه سازی: 23 شهریور 1401

Abstract:

بیماری های کاچکسیا ناشی از ویروئیدCitrus Cachexia viroid, CCaVd  و اگزوکورتیس ناشی از ویروئید Citrus exocortis viroid, CEVd مهم ترین بیماری های ویروئیدی مرکبات در جهان هستند. ویروئیدها با روش های متداول سرولوژیکی قابل شناسایی نبوده و روش های فعلی تشخیص آنها عموما وقت گیر، پر هزینه و با محدودیت هایی همراه است. در این بررسی امکان خالص سازی و شناسایی دقیق این ویروئیدها با استفاده از ستون کروماتوگرافیCF-۱۱ بررسی شد. طی سال های۱۳۹۰ تا ۱۳۹۲، از سرشاخه های۲۲ درخت نارنگی و ۱۵ درخت پرتقال به ترتیب واجد علائم بیماری های کاچکسیا و اگزوکورتیس در شرق مازندران نمونه برداری شد. بافت برگ پس از پودر شدن با بافر استخراج مخلوط شد. خالص سازی در ستون حاوی پودر سلولز انجام و با افزودن اتانول، مولکول های آر ان ای دو رشته ای استخراج و توسط استات سدیم رسوب داده شد. رسوب حاصل در آگارز یک درصد الکتروفورز و دو باند اختصاصی در محدوده های ۳۰۰ تا ۴۰۰ جفت باز (فرم خطی) و۷۸۰۰ -۷۰۰۰ جفت باز (فرم حلقوی) مرتبط با این دو ویروئید به دست آمد که به ترتیب در ماه های گرم و در تمامی ماه های سال با این روش قابل شناسایی بود. ماهیت RNA دورشته ای باندهای به دست آمده، با عدم تخریب آنها توسط آنزیم DNase وهمچنین RNase در حضور محلول نمک طعام ۰.۳ مولار و حلالیت آن ها در محلول LiCl تایید شد. ماهیت ویروئیدی باندهای به دست آمده توسط واکنش زنجیره ای پلی مراز (RT-PCR) با استفاده از آغازگرهای اختصاصی CEVd و CCaVd تعیین گردید. تعداد ۵۰۰ نهال پرتقال و ۳۰۰ نهال نارنگی در آزمون سلامت نهال با این روش بررسی شد.با توجه به تکرار پذیری و قابل اعتماد بودن این روش و تایید ماهیت باندهای به دست آمده با آغازگر اختصاصی هر یک از این دو ویروئید در واکنش زنجیره ای پلی مراز، این روش برای تشخیص ویروئیدهای مرکبات در برنامه های کاربردی تولید نهال سالم با صرف حداقل زمان و هزینه پیشنهاد می گردد.

Authors

سید وحید علوی

استادیار بخش تحقیقات گیاه پزشکی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان مازندران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، ساری، ایران

پرسا تیموری

دانش آموخته ی کارشناسی ارشد گروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • AlAVI, S. V., P. TEIMOURI and H. R. ZAMANIZADE, ۲۰۱۰. ...
  • AlAVI, V., B. KHATABI and G. HOSSEINI SALEKDEH, ۲۰۰۵. Comparison ...
  • ALMAYDA-LEON, I. H., M. A. ROCH-PENA, M. M. IRACHETACARDENAS, F. ...
  • ALVARADO-GOMEZ, O. G., M. A. ROCH-PENA, S. SILVA-VARA, J. P. ...
  • BEAUDRRY, D. and J. P. PERREAULT, ۱۹۹۵. An efficient strategy ...
  • BEN–SHAUL, A., Y. GUANG, N. MOGILNER, R. HADAS, M. MAWASSI, ...
  • BITTER, W. P., N. DURAN-VILA and J. S. SEMANCIK, ۱۹۸۷. ...
  • DE LATORRE, S. M. E., C. LOPEZ, O. GRAU and ...
  • DODDS, J. A. and M. BAR-JOSEPH, ۱۹۸۳. Double Stranded RNA ...
  • FALAKI, F., S. V. ALAVI and F. RAKHSHANDEHROO, ۲۰۱۳. Citrus ...
  • FLORES, R., C. HERNANDES, A. MARTINEZDE-ALBA, A. DAROS and F. ...
  • FRANCIS, M. I., J. A. SZYCHOWSKI and J. S. SEMANSIK, ...
  • FRISON, E. A. and M. M. TAHER, ۱۹۹۱. FAO/IBPGR technical ...
  • GARNSEY, S. M., D. L. ZIES, M. IREY, P. J. ...
  • HULL, R. ۲۰۰۲. “Mathews Plant Virology” (۴th edition). Academic Press, ...
  • KEES, P. and R. H. SYMONS, ۱۹۸۵. Domain in Viroids: ...
  • LEVY, L. and A. HADIDI, ۱۹۹۳. Direct nucleotide sequencing of ...
  • MORRIS, T. J. and J. A. DODDS, ۱۹۷۹. Isolation and ...
  • REZAIAN, M. A. ۱۹۹۹. Synthesis of infectious viroids and other ...
  • RIVERA-BUSTAMANTE, R. F., R. GIN and J. S. SEMANCIK, ۱۹۸۶. ...
  • ROISTACHER. C. N. ۱۹۹۱. Graft - Transmissible Diseases of Citrus ...
  • SEMANCIK, J. S. and C. N. ROISTACHER, ۱۹۸۸. A new ...
  • TIETZ, D. ۱۹۹۸. Nucleic Acid Electrophoresis. Springer, Berlin, Germany. ۳۲۸ ...
  • WAGNER, R. W. and L. SUN, ۱۹۹۸. Double- stranded RNA ...
  • YANG, X. A., A. HADIDI and S. M. GARNSEY, ۱۹۹۲. ...
  • نمایش کامل مراجع