بررسی توالی ژن پروتئین پوششی جدایه های ایرانی ویروس ایکس هوستا

در بهار سال ۱۳۹۰ طی بازدیدی از مراکز تولید گیاهان زینتی در شهرستان های کرج و تنکابن، تعدادی بوته هوستا (Hosta sieboldiana.) با علائم موزائیک، پیسک و بدشکلی برگ ها مشاهده شد. تعداد ۱۷ بوته علائم دار انتخاب شد و احتمال آلودگی آنها به ویروس های موزائیک آرابیس (Arabis mosaic virus-ArMV)، موزائیک خیار (Cucumber mosaic virus-CMV)، پژمردگی لکه ای گوجه فرنگی (Tomato spotted wilt virus-TSWV)، لکه نکروز گل حنا (Impatiens necrotic spot virus-INSV) و لکه حلقوی گوجه فرنگی (Tomato ring spot virus-ToRSV) در آزمون سرولوژیک داس الایزا (DAS-ELISA) بررسی شد. نمونه های مورد بررسی با هیچ یک از آنتی بادی های اختصاصی ویروس های فوق الذکر واکنش نشان ندادند. مایه زنی مکانیکی برخی از نمونه های علائم دار منجر به تولید لکه های نکروزه روی گل دکمه ای (Gomphrena globosa) و علائم سیستمیک پیسک در Nicotiana bentamian گردید. بررسی نمونه های هوستا با استفاده از روش مولکولی (RT-PCR) و آغازگرهای اختصاصی طراحی شده در این تحقیق برای تکثیر ناحیه ژن پروتئین پوششی ویروس ایکس هوستا (Hosta virus X-HVX)، منجر به تولید قطعه دی.ان.ای به طول تقریبی ۷۰۰ جفت باز گردید. مقایسه توالی ژن پروتئین پوششی پنج جدایه ایرانی HVX با ۵۵ توالی موجود در بانک ژن حاکی از وجود درصد بالای یکنواختی (۵/۹۸ تا ۵/۹۹%) در سطح توالی نوکلئوتیدی بین آن ها بود. کمترین یکنواختی توالی (۵/۹۸ درصد) بین جدایه ایرانی HVX.Ir.TnK۲ با جدایه AJ۶۲۰۱۱۴ از کره جنوبی تعیین گردید. این اولین گزارش از وقوع ویروس ایکس هوستا در ایران است و توالی نوکلئوتیدی ژن پروتئین پوششی جدایه های ایرانی HVX برای اولین بار در این تحقیق تعیین و مقایسه شد.

Keywords:

Hosta virus X , RT-PCR , تبارزایی