ردیابی و شناسایی مولکولی جدایه های ویروئید کوتولگی رازک آلوده کننده درختان مو در برخی از مناطق ایران
Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 14، Issue: 3
Publish Year: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 120
This Paper With 24 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JOAGK-14-3_007
تاریخ نمایه سازی: 11 مهر 1401
Abstract:
هدف: ویروئید کوتولگی رازک، (Hop stunt viroid, HSVd) گسترده ترین دامنه میزبانی را در بین ویروئیدها دارا می باشد و از مناطق مختلف دنیا گزارش شده است. هدف از این تحقیق، ردیابی، شناسایی و تعیین جایگاه تاکسونومیکی جدایه های ویروئید کوتولگی رازک در تاکستان های استان کرمان و برخی نقاط دیگر کشور می باشد. مواد و روش ها: در طی تابستان سال های ۱۳۹۷ تا ۱۳۹۹، در مجموع ۷۴ نمونه ی برگی از درختان انگور استان کرمان و دو استان آذربایجان شرقی (تبریز) و فارس (بیضا) جمع آوری شد و آلودگی نمونه ها به HSVd توسط آزمون RT-PCR مورد بررسی قرار گرفت. توالی ژنوم کامل هفت جدایه HSVd حاصل تعیین ترادف گردید و با توالی های موجود در بانک ژن مقایسه شدند. جهت بررسی روابط فیلوژنتیکی ترادف های بدست آمده با سایر ترادف های این ویروئید، از نرم افزار (version ۷)MEGA و روش neighbor-joining استفاده شد. همچنین میزان همولوژی جدایه ها نیز توسط نرم افزار SDT v۱.۲ بررسی شد. جهت تعیین دامنه میزبانی و بررسی علائم از هشت گونه و رقم گیاهی استفاده گردید. نتایج: مطابق با گزارش های پیشین توالی های HSVd به پنج گروه فیلوژنتیکی Citrus، Hop، Plum، Plum-Hop/cit۳ و Plum-Citrus تقسیم بندی شدند. نتایج این تحقیق نشان داد اندازه ژنوم جدایه های تعیین توالی شده از درختان انگور متغیر (بین ۲۹۷ تا ۳۰۰ نوکلئوتید) و با یکدیگر، ۷/۹۸ - ۳/۹۳ درصد تشابه داشتند. براین اساس، هفت جدایه گزارش شده در این بررسی همراه با چند جدایه گزارش شده دیگر از درختان انگور از ایران و نیز کشور آلمان در گروه اصلی Hop واقع گردیدند. سه جدایه حاصل از درختان انگور باغات استان کرمان به همراه چهار جدایه گزارش شده از این درختان، از کشور آلمان و ایران، یک زیر گروه در گروه رازک تشکیل دادند. همچنین چهار جدایه ایرانی شناسایی شده از درختان پسته در استان کرمان با تعدادی جدایه گزارش شده از درختان پسته کشور تونس (با منشاء ایرانی) نیز در گروه رازک قرار گرفتند. نتیجه گیری: از آنجائی که آلودگی درختان انگور در ایران نسبت به HSVd قبل از آلودگی درختان پسته گزارش گردیده، بنابراین احتمالا آلودگی گیاهان پسته به HSVd در ایران به واسطه ی آلودگی متقاطع و انتقال آلودگی از درختان انگور به درختان پسته رخ داده است. براین اساس با توجه به نتایج حاصل از مطالعات ملکولی و شواهد موجود، درختان انگور می توانند به عنوان مبداء آلودگی درختان پسته در ایران باشند.
Keywords:
Authors
سحر بارانی
بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
حسین معصومی
کرمان، دانشگاه شهید باهنر، دانشکده کشاورزی، بخش گیاهپزشکی
محمد مداحیان
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
جهانگیر حیدرنژاد
بخش گیاهپزشکی،دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
اکبر حسینی پور
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :