طراحی واکنش زنجیره ای پلی مراز بهبودیافته جهت تشخیص مولکولی باکتری استرپتوکوکوس نیومونیا

Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 39

This Paper With 8 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_MUQ-7-4_012

تاریخ نمایه سازی: 2 آبان 1401

Abstract:

زمینه و هدف: باکتری استرپتوکوکوس نیومونیا عامل مننژیت باکتریایی و یک عامل مهم مرگ و میر در کودکان و افراد سالخورده است. کنترل این بیماری نیز وابسته به تشخیص سریع باکتری می باشد. روش های تشخیص این باکتری شامل رنگ آمیزی گرم، کشت و تست های سرولوژیکی است. این روش ها وقت گیر و در اثر مصرف آنتی بیوتیک منجر به نتایج منفی کاذب می شوند. در حال حاضر، روش های مولکولی مانند PCR به صورت روزانه برای تشخیص عوامل عفونی استفاده می شوند. این مطالعه با هدف طراحی یک واکنش بهبودیافته PCR جهت تشخیص باکتری استرپتوکوکوس نیومونیا صورت گرفت. روش بررسی: پرایمرهای تشخیصی اختصاصی براساس ژن ply باکتری طراحی گردید. پس از تکثیر ژن هدف در DNA ژنومی باکتری، محصول PCR در پلاسمید pTZ۵۷R/T کلون شد و پلاسمید تاییدشده pTZ-ply به عنوان کنترل مثبت در آزمایشهای بعدی مورد استفاده قرار گرفت. جهت تعیین حساسیت واکنش، رقت های متوالی ۱۰ تایی از پلاسمید pTZ-ply تهیه و بر روی آنها واکنش PCR انجام گرفت. برای تعیین ویژگی واکنش از ژنوم تعدادی باکتری مرتبط یا غیرمرتبط در واکنش  PCRاستفاده شد. یافته ها: نتایج PCR مطابق انتظار، قطعه ۷۲۷ جفت باز را نشان داد. هیچ گونه تکثیری در PCR بر روی ژنوم باکتری های کنترل منفی دیده نشد. این نتایج نشان دهنده ویژگی بالای واکنش PCR بود. پایین ترین حد تشخیص این آزمون در تشخیص ژن ply، ۲۵۰ کپی از ژن در یک واکنش ۲۵ میکرولیتری بود. نتیجه گیری: حساسیت، ویژگی و سرعت بالای آزمون طراحی شده، آن را به عنوان یک تست مناسب برای استفاده در آزمایشگاه های کلینیکی مطرح می کند. همچنین ارزیابی بیشتر این آزمون با استفاده از نمونه های کلینیکی یا مواد آلوده شده مصنوعی، کاربرد این روش را در مجموعه ای کلینیکی تایید خواهد کرد.

Keywords:

Polymerase Chain Reaction , Polymerase Chain Reaction-Methods , Rapid Detection , Streptococcus pneumoniae , واکنش زنجیره ای پلی مراز , واکنش زنجیره ای پلی مراز- روش ها , تشخیص سریع , استرپتوکوکوس نیومونیا

Authors

فهیمه آقامیری

Islamic Azad University, Qom Branch

محمد سلیمانی

Islamic Azad University, Qom Branch

امیرحسین محسنی

Islamic Azad University, Qom Branch

کیوان مجیدزاده

Aja University of Medical Sciences

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Kaijalainen T, Saukkoriipi A, Bloigu A, Herva E, Leinonen M. ...
  • Rintamaki S, Saukkoriipi A, Salo P, Takala A, Leinonen M. ...
  • Werno AM, Murdoch DR. Medical Microbiology: Laboratory Diagnosis of Invasive ...
  • Carroll KC. Laboratory Diagnosis of Lower Respiratory Tract Infections: Controversy ...
  • Selva L, Esteva C, Gené A, de Sevilla MF, Hernandez-Bou ...
  • Wei CY, Kuo TBJ, Yau HY, Yeh SY, Tsai YC, ...
  • Van Haeften R, Palladino S, Kay I, Keil T, Heath ...
  • Michelow IC, Lozano J, Olsen K, Goto C, Rollins NK, ...
  • Santos L, Simões J, Severo M, Vazquez J, Lecour H. ...
  • Matos JA, Madureira DJ, Rebelo MC, Hofer CB, Barroso DE. ...
  • Radstrom P, Backman A, Qian N, Kragsbjerg P, Pahlson C, ...
  • Morrison KE, Lake D, Crook J, Carlone GM, Ades E, ...
  • Jado I, Fenoll A, Casal J, Perez A. Identification of ...
  • Saukkoriipi A, Leskela K, Herva E, Leinonen M. Streptococcus pneumoniae ...
  • Salo P, Örtqvist Å, Leinonen M. Diagnosis of Bacteremic Pneumococcal ...
  • Jedrzejas MJ. Pneumococcal Virulence Factors: Structure and Function. Microbiol Mol ...
  • Alonsod Evelasco E vAFM. Streptococcus pneumoniae: Virulance Factors, Pathogenesis and ...
  • Walker JA, Allen RL, Falmagne P, Johnson MK, Boulnois GJ. ...
  • Chiang YC, Yang CY, Li C, Ho YC, Lin CK, ...
  • Weber DJ, Rutala WA. Streptococcus pneumoniae Infections: Microbiology, Epidemiology, Treatment, ...
  • Sourav S, Sharma S, Kanungo R, Jayachandran S, Prashanth K. ...
  • Ragunathan L, Ramsay M, Borrow R, Guiver M, Gray S, ...
  • Hassan-King M, Baldeh I, Secka O, Falade A, Greenwood B. ...
  • نمایش کامل مراجع