Transferability of wheat SSR markers for determination of genetic diversity and relationships of barley varieties
Publish place: Journal of Plant Physiology and Breeding، Vol: 10، Issue: 2
Publish Year: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: English
View: 300
This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_BREDNG-10-2_008
تاریخ نمایه سازی: 17 آذر 1401
Abstract:
Simple sequence repeat (SSR) markers are simple PCR-based co-dominant markers, which are highly polymorphic and informative due to the number and frequency of alleles, and thus they are most utilized among the molecular markers. However, the development of SSR markers is costly and time-consuming. Cross-species transferability of SSRs allows the SSRs isolated from one species to apply on a closely related species, which increases the utility of previously isolated SSRs. This study demonstrated the cross-species transferability of ۱۹۶ SSR primer pairs of wheat in genetic diversity analysis of ۴۰ varieties of barley (Hordeum vulgare L.). Of the ۱۹۶ SSR primer pairs assayed, ۵۹ (۳۰.۱%) showed transferability. Of the ۵۹ primer pairs, ۲۱ pairs were polymorphic with the polymorphism information content ranging from ۰.۱۹ to ۰.۷۰. The number of alleles detected at each locus ranged from one to seven with an average of ۳.۵۷. Cluster analysis using the Minimum Evolution algorithm and the coefficient of Number of Differences assigned the genotypes into five groups.
Keywords:
Authors
هما زلقی
Department of Plant Breeding and Biotechnology, University of Tabriz, Tabriz, Iran.
سید ابوالقاسم محمدی
Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran.
محمد مقدم
Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran.
بهزاد صادق زاده
Dryland Agriculture Research Institute of Iran, Maragheh, Iran.
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :