بررسی بیوانفورماتیکی تاثیر ترکیبات گیاهی موجود در گیاهان دارویی Ferulago angulat، Scrophularia striata و Laurus nobilis در مهار پروتئین های موثر در بروز مقاومت آنتی بیوتیکی در استافیلوکوکوس اورئوس: یک مطالعه توصیفی
عنوان مقاله: بررسی بیوانفورماتیکی تاثیر ترکیبات گیاهی موجود در گیاهان دارویی Ferulago angulat، Scrophularia striata و Laurus nobilis در مهار پروتئین های موثر در بروز مقاومت آنتی بیوتیکی در استافیلوکوکوس اورئوس: یک مطالعه توصیفی
شناسه ملی مقاله: JR_RUMS-18-2_007
منتشر شده در در سال 1398
شناسه ملی مقاله: JR_RUMS-18-2_007
منتشر شده در در سال 1398
مشخصات نویسندگان مقاله:
زینب شاکران - department of biology, faculty of science, University of Isfahan
زهرا شاکران - Department of Biotechnology, Faculty of advanced science and technologies, University of Isfahan
مختار نصرتی - Department of Biotechnology, Faculty of advanced science and technologies, University of Isfahan
خلاصه مقاله:
زینب شاکران - department of biology, faculty of science, University of Isfahan
زهرا شاکران - Department of Biotechnology, Faculty of advanced science and technologies, University of Isfahan
مختار نصرتی - Department of Biotechnology, Faculty of advanced science and technologies, University of Isfahan
چکیده
زمینه و هدف: اخیرا عفونتهای ناشی از استافیلوکوکوس اورئوس (Staphylococcus aureus; S. aureus) و ایجاد جدایه های مقاوم به آنتی بیوتیکها افزایش یافته است. بنابراین مطالعات فراوانی به منظور معرفی ترکیبات جدید با فعالیت ضد S. aureus بهویژه ترکیباتی با منشاء طبیعی جهت مقابله با گونههای مقاوم به آنتی بیوتیک انجام گرفته است. هدف از این مطالعه تعیین غربالگری بیوانفورماتیکی مهارکنندههای نوین پروتئینهای مرتبط با بروز مقاومت آنتیبیوتیکی موجود در گیاهان دارویی بود.
مواد و روشها: در این مطالعه توصیفی، ابتدا ساختار سه بعدی ترکیبات فیتوشیمیایی موجود در سه گیاه دارویی Ferulago angulat، Scrophularia striata و Laurus nobilis از پایگاه داده PubChem دریافت شد. سپس ساختار سه بعدی چهار پروتئین مرتبط با بروز مقاومت آنتیبیوتیکی شامل β-lactamase، پروتئین متصل شونده به پنی سیلین a۲ (a۲PBP)، ونکومایسین A (VanA) و D-آلانیل D-آلانین دی پپتیداز (VanX) به کمک پایگاه دادههای پروتئین به دست آمد. در نهایت، توانایی ترکیبات شیمیایی انتخاب شده جهت مهار پروتئینهای مرتبط با مقاومت آنتی بیوتیکی مذکور با استفاده از روش داکینگ مولکولی بهوسیله نرم افزار ۱. ۲iGemdock بررسی شد.
یافته ها: نتایج نشان داد که اکثر ترکیبات مورد بررسی، برهمکنشهای مناسبی با تمامی پروتئینهای مورد مطالعه به ویژهVanX دارند. نتایج همچنین نشان داد که دو ترکیب Phthalate (ethylhexyl-۲)Bis و Palmitic acid قویترین برهمکنشها را با تمامی پروتئینهای مورد بررسی دارند.
نتیجهگیری: نتایج این مطالعه نشان داد که که دو ترکیب Phthalate (ethylhexyl-۲)Bis و Palmitic acid موجود در گیاهان دارویی بررسی شده کاندیدهای مناسبی برای مطالعات برون تنی و درون تنی مرتبط با فعالیت ضد S .aureus مقاوم به آنتیبیوتیک میباشند.
واژههای کلیدی: استافیلوکوکوس اورئوس، مقاومت آنتی بیوتیکی، گیاهان دارویی، بیوانفورماتیک
کلمات کلیدی: Staphylococcus aureus, Antibiotic resistance, Medicinal plants, Bioinformatics., استافیلوکوکوس اورئوس, مقاومت آنتی بیوتیکی, گیاهان دارویی, بیوانفورماتیک
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1586651/