مطالعه ارتباط ژنومی چند جمعیتی مشترک برای شناسایی مکان های ژنومی موثر بر چندقلوزایی در گوسفند
عنوان مقاله: مطالعه ارتباط ژنومی چند جمعیتی مشترک برای شناسایی مکان های ژنومی موثر بر چندقلوزایی در گوسفند
شناسه ملی مقاله: JR_ARGU-11-3_002
منتشر شده در در سال 1401
شناسه ملی مقاله: JR_ARGU-11-3_002
منتشر شده در در سال 1401
مشخصات نویسندگان مقاله:
محسن قلی زاده - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
سید مهدی اسماعیلی فرد - دانش آموخته دکتری، گروه علوم دامی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
خلاصه مقاله:
محسن قلی زاده - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
سید مهدی اسماعیلی فرد - دانش آموخته دکتری، گروه علوم دامی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
چندقلوزایی یکی از مهمترین صفات اقتصادی در گوسفند با تنوع داخل و بین نژادی است. این مطالعه به منظور شناسایی مکانهای ژنومی موثر بر چندقلوزایی در گوسفند با رویکرد مگاآنالیز مطالعه ارتباط ژنومی و با استفاده از دادههای ژنوتیپی و فنوتیپی شش نژاد گوسفند از پایگاه داده انجام شد. کنترل کیفیت با استفاده از نرم افزار Plink و ایمپیوتیشن با روش LD-kNNi انجام شد. مگاآنالیز با استفاده از مدل خطی مختلط در نرم افزار TASSEL با در نظر گرفتن خویشاوندی و ساختار جمعیت انجام شد. پس از پایان کنترل کیفیت، تعداد ۳۰۵ حیوان و ۳۵۱۶۱۵ نشانگر SNP با متوسط MAF برابر با ۳۳/۰ برای ادامه تجزیه مورد استفاده قرار گرفتند. نتایج مگاآنالیز، یک SNP را روی کروموزوم ۲۱ در سطح ژنوم و ۱۰ SNP در سطح کروموزومی روی کروموزوم های ۱، ۲، ۳، ۱۴، ۱۷ و ۲۲ شناسایی کرد که بهطور معنیداری با چندقلوزایی در گوسفند در ارتباط بودند. ژنهای OPCML، GULP۱، RBP۴، MMP۲ و LPCAT۲ شناسایی شده در این تحقیق، نقش موثری در باروری و موفقیت آبستنی دارند. نتایج این تحقیق می تواند در درک ساز و کار ژنتیکی کنترلکننده چندقلوزایی در گوسفند مورد استفاده قرار گیرد.
کلمات کلیدی: چندقلوزایی, گوسفند, مطالعه ارتباط ژنومی, مگاآنالیز, نشانگر
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1599863/