تجزیه و تحلیل مجموعه های ژنی جهت شناسایی ژن ها و مسیرهای زیستی مرتبط با صفات وزن بدن در مرغ
عنوان مقاله: تجزیه و تحلیل مجموعه های ژنی جهت شناسایی ژن ها و مسیرهای زیستی مرتبط با صفات وزن بدن در مرغ
شناسه ملی مقاله: JR_ARGU-9-3_004
منتشر شده در در سال 1399
شناسه ملی مقاله: JR_ARGU-9-3_004
منتشر شده در در سال 1399
مشخصات نویسندگان مقاله:
امیر حسین خلت آبادی فراهانی - استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
حسین محمدی - استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
محمد حسین مرادی - استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
حسینعلی قاسمی - دانشیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
ایمان حاج خدادادی - استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
خلاصه مقاله:
امیر حسین خلت آبادی فراهانی - استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
حسین محمدی - استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
محمد حسین مرادی - استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
حسینعلی قاسمی - دانشیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
ایمان حاج خدادادی - استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
این پژوهش به منظور مطالعه پویش کل ژنوم بر پایه تجزیه و تحلیل غنیسازی مجموعه ژنی جهت شناسایی جایگاههای ژنی موثر بر وزن بدن در سنین مختلف چهار نژاد مرغ چوآ، سیلک، لنگشن و بیرد با استفاده از آرایههای ژنومی با تراکم بالا انجام شد. اطلاعات رکوردهای فنوتیپی و ژنوتیپی نمونهها از پایگاه ذخیره ژنومی برخط Frontiersin استفاده شد. مطالعه پویش کل ژنومی از ۴۰۲ قطعه مرغ و خروس با صفات وزن بدن از هفته اول تا ۱۵ هفتگی در برنامه GenABEL ارزیابی شد. در مرحله بعد، تجزیه غنیسازی مجموعه ژنی با بسته نرم افزاری goseq برنامه R با هدف شناسایی عملکرد زیستی ژنهای نزدیک در مناطق انتخابی کاندیدا با پایگاههای GO، KEGG، DAVID و PANTHER انجام شد. در این پژوهش، تعداد ۱۰ نشانگر تک نوکلئوتیدی واقع روی کروموزومهای ۱، ۲، ۵، ۷، ۱۰، ۱۴، ۱۸، ۱۹، ۲۰ و ۲۷ شناسایی شدند که با ژنهای ABCG۱، MYOD۱، MYH۱۰، MYH۱۱، MYO۱B، MYO۱C، MYO۱E، MYL۱، MYL۲، MYL۳، SLC۲A۸، ACACA، ACOX۱، ACOX۲ و PNPLA۲ مرتبط بودند. برخی از این ژنها در مناطق معنیدار با مطالعات قبلی همخوانی داشتند. در تجزیه غنیسازی مجموعه ژنی، تعداد ۱۷ مسیر هستیشناسی ژنی و بیوشیمیایی با صفات وزن بدن شناسایی شدند (۰۱/۰P˂). از این بین، مسیرهای cytoskeletal protein binding،anatomical structure development و Tricarboxylic acid cycle نقش مهمی در توسعه الیاف عضلانی اسکلتی و سوخت و ساز چربی داشتند. با توجه به تایید مناطق قبلی پویش ژنومی صفات وزن بدن و شناسایی مناطق ژنومی جدید، استفاده از یافتههای این تحقیق میتواند سبب تسریع در پیشرفت ژنتیکی برنامههای اصلاح نژادی مرغ شود.
کلمات کلیدی: تجزیه بر پایه مسیر, ژن کاندیدا, مرغ, وزن بدن
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1604557/