ردیابی و تعیین خصوصیات ملکولی ویروئید فرورفتگی میوه سیب(Apple Dimple Viroid) در منطقه مراغه
عنوان مقاله: ردیابی و تعیین خصوصیات ملکولی ویروئید فرورفتگی میوه سیب(Apple Dimple Viroid) در منطقه مراغه
شناسه ملی مقاله: JR_ARPP-7-2_009
منتشر شده در در سال 1397
شناسه ملی مقاله: JR_ARPP-7-2_009
منتشر شده در در سال 1397
مشخصات نویسندگان مقاله:
وحید رومی - استادیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه مراغه.
خلاصه مقاله:
وحید رومی - استادیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه مراغه.
چکیده در تابستان سالهای ۱۳۹۵ و ۱۳۹۶ تعداد ۷۳ نمونه با علائم مشابه با ویروئید فرورفتگی میوه سیب از ارقام گالا و رد دلیشیز منطقهی مراغه جمعآوری شد. RNA کل از پوست ساقه و برگ نمونههای جمعآوری شده حاوی علایم لکههای فرورفته و خالهای زرد با حاشیه نامنظم روی پوست میوه، استخراج گردید و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژنوم کامل ویروئید به طول ۳۰۷-۳۰۶ جفت باز با آزمون RT-PCR تکثیر و ترادف ۱۰ نمونه تعیین گردید. جستجوی ترادف ها با BLASTn و همردیفسازی آنها با ترادفهای مربوطه در بانک ژن نشان داد که جدایههای مورد مطالعه دارای بیشترین و کمترین یکسانی ترادف به میزان ۱۰۰ و ۴/۷۴ درصد بترتیب با رس شمارهای EF۰۸۸۶۶۲ (ایتالیا) و KF۷۸۸۲۹۱ (ایتالیا) میباشند. بیشترین تفاوت نوکلئوتیدی در بین نواحی CCRو TR قرار داشتند. آنالیز فیلوژنتیک با روش حداکثر احتمال نشان داد که جدایه های ایرانی به همراه جدایهها و واریانتهای گزارش شده از ایتالیا در یک گروه قرار می گیرند.
کلمات کلیدی: واژههای کلیدی: ردیابی, ویروئید, فرورفتگی میوه, سیب, ایران
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1616182/