بررسی تنوع ژنومی ارقام پسته مقاوم و حساس به آفت پسیل با استفاده از روش توالی یابی کل ژنوم

Publish Year: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 188

This Paper With 8 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_GEB-11-1_006

تاریخ نمایه سازی: 15 اسفند 1401

Abstract:

پسته یکی از مهم ترین محصولات باغی است که به دلیل دوپایه بودن و هتروزیگوسیتی بالا، دارای تنوع ژنتیکی زیادی است، از این رو شناسایی تنوع ژنتیکی موجود در بین ژنوتیپ های پسته در جهت اصلاح و تولید ارقام مقاوم به پسیل اهمیت ویژه ای دارد. پسیل پسته یکی از مهم ترین آفات درخت پسته است که پوره و حشرات بالغ این آفت با مصرف شیره گیاه سبب افزایش میزان پوکی، عدم خندانی و همچنین کاهش عملکرد می شود. در این پژوهش چندشکلی های تک نوکلئوتیدی و حذف و اضافه کوچک در چند رقم ایرانی پسته حساس (اکبری، کله قوچی، احمدآقایی، ممتاز) و مقاوم (بادامی زرند، حاج عبداللهی، ایتالیایی، سرخس) به پسیل مورد بررسی قرار گرفت. ابتدا خوانش ها با ژنوم مرجع هم ردیف شدند و سپس چندشکلی های تک نوکلئوتیدی و حذف و اضافه های کوچک مشخص شدند. درصد هم ردیفی خوانش ها با ژنوم مرجع بالای ۹۶ درصد بود که نشان دهنده کیفیت بالای هم ردیفی بود. ارقام حساس به ترتیب دارای ۲۹۲۰۶۸۸ و ۷۰۱۱۰۹ و ارقام مقاوم دارای ۲۹۱۹۸۹۸ و ۷۰۱۰۰۰ چندشکلی تک نوکلئوتیدی و حذف و اضافه کوچک بود. در مجموع، نتایج تجزیه و تحلیل داده ها نشان داد که تنوع ساختاری و چندشکلی تک نوکلئوتیدی و حذف اضافه کوچک ژنوم در ارقام حساس بیشتر از ارقام مقاوم است.

Authors

مرضیه سعادتی جبلی

Department of Biotechnology, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University

حسن مرعشی

Department of Biotechnology, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University, Mashhad, Iran.

فرج الله شهریاری

Department of Biotechnology, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University

علیرضا سیفی

Department of Biotechnology, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University

لیدا فکرت

Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University, Mashhad, Iran

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Aliakbarkhani ST, Akbari M, Hassankhah A, Talaie A, Moghadam, MF. ...
  • Alibeigi AH, Heidari N, Kheirollah M. ۲۰۱۷. The Impact of ...
  • Andolfo G, Dohm JC, Himmelbauer H. ۲۰۲۲. Prediction of NB‐LRR ...
  • Cingolani P, Platts A, Wang LL, Coon M, Nguyen T, ...
  • Collins DW and Jukes TH. ۱۹۹۴. Rates of transition and ...
  • Dehghani-Yakhdani H, Iranipour S, Mehrnejad MR, Farshbaf-Pourabad R. ۲۰۱۹. The ...
  • FAO. ۲۰۲۰. FAOSTAT. Food and agricultural commodities production. Available at ...
  • FAO. ۲۰۲۱ FAOSTAT. Food and agricultural commodities production. Available at ...
  • Grace MH, Esposito D, Timmers MA, Xiong J, Yousef G, ...
  • Horgan F. ۲۰۱۷. Integrated pest management for sustainable rice cultivation: ...
  • Hussain A, Farooq M, Naqvi RZ, Aslam MQ, Siddiqui HA, ...
  • Kafkas S. ۲۰۱۹. Advances in Breeding of Pistachio. Burleigh Dodds ...
  • Karci H, Kafkas S. ۲۰۲۲. Evaluation of Genetic Structure of ...
  • Kola O, Hayoglu I, Turkoglu H, Parıldı E, Ak BE, ...
  • Lachagari VR, Gupta R, Lekkala SP, Mahadevan L, Kuriakose B, ...
  • Lefebvre V, Boissot N, Gallois JL. ۲۰۲۰. Host plant resistance ...
  • Li H, Durbin R. ۲۰۰۹. Fast and accurate short read ...
  • Li H, Handsaker B, Wysoker A, Fennell T, Ruan J, ...
  • McKenna A, Hanna M, Banks E, Sivachenko A, Cibulskis K, ...
  • Mehrnejad MR, Copland MJ. ۲۰۰۶. Biological parameters of parasitoid Psyllaephagus ...
  • Mehrnejad MR. ۲۰۲۰. Arthropod pests of pistachios, their natural enemies ...
  • Mehrnejad, MR. ۲۰۰۳. Pistachio psylla and other major psyllids of ...
  • Mostafavi M, Lashkari M, Iranmanesh S, Mansouri SM. ۲۰۱۷. Variation ...
  • Mullaney JM, Mills RE, Pittard WS, Devine S.E. ۲۰۱۰. Small ...
  • Niksiar P, Navvabpour S. ۲۰۱۸. Haplotype Diversity For QTL Associated ...
  • Notter DR. ۱۹۹۹. The importance of genetic diversity in livestock ...
  • Segawa T, Nishiyama C, Tamiru-Oli M, Sugihara Y, Abe A, ...
  • Sheikhi M, Fakheri B, Mahdinezhad N. ۲۰۱۹. Study of genetic ...
  • Sims D, Sudbery I, Ilott NE, Heger A, Ponting CP. ...
  • Singhabahu S, Wijesinghe C, Gunawardana D, Senerath-Yapa MD, Kannangara M, ...
  • Sorokin A. ۲۰۱۸. Botanical identification of ancient Hebrew phytonym boṭnim. ...
  • Stansfield W, Elrod S. ۲۰۰۵. Schaum's outline of theory and ...
  • Subudhi PK, Shankar R, Jain M. ۲۰۲۰. Whole genome sequence ...
  • Subudhi PK, Shankar R, Jain M. ۲۰۲۰. Whole genome sequence ...
  • Swarup S, Cargill EJ, Crosby K, Flagel L, Kniskern J, ...
  • Taephe Ali Akbarkhani S, Talaei A, Fatehi Moghadam M. ۲۰۱۳. ...
  • Taghizadeh SF, Rezaee R, Davarynejad G, Karimi G, Nemati SH, ...
  • Tajabadi A, Esmailizadeh A. ۲۰۲۱. Whole genome resequencing data sets ...
  • Widmer RJ, Flammer AJ, Lerman LO, Lerman A. ۲۰۱۵. The ...
  • Wu D, Wang C, Zhang Z, Guo C, Chen Q, ...
  • Zeng L, Tu XL, Dai H, Han FM, Lu BS, ...
  • Ziya Motalebipour E, Kafkas S, Khodaeiaminjan M, Coban N, Gozel ...
  • نمایش کامل مراجع