شناسایی ریز RNA های نامزد دخیل در تحمل سرما در نخود زراعی
عنوان مقاله: شناسایی ریز RNA های نامزد دخیل در تحمل سرما در نخود زراعی
شناسه ملی مقاله: JR_GEB-11-1_004
منتشر شده در در سال 1401
شناسه ملی مقاله: JR_GEB-11-1_004
منتشر شده در در سال 1401
مشخصات نویسندگان مقاله:
علیرضا اکبری - Department of Plant Production and Genetic Engineering, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran.
احمد اسماعیلی* - Department of Plant Production and Genetic Engineering, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran.
زهرا سادات شبر - Department of Systems Biology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII), Agricultural Research, Education and Extension Organization, Karaj, Iran
نازنین امیربختیار - Seed and Plant Improvement Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization, Karaj, Iran
معصومه پوراسماعیل - Seed and Plant Improvement Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization, Karaj, Iran
خلاصه مقاله:
علیرضا اکبری - Department of Plant Production and Genetic Engineering, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran.
احمد اسماعیلی* - Department of Plant Production and Genetic Engineering, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran.
زهرا سادات شبر - Department of Systems Biology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII), Agricultural Research, Education and Extension Organization, Karaj, Iran
نازنین امیربختیار - Seed and Plant Improvement Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization, Karaj, Iran
معصومه پوراسماعیل - Seed and Plant Improvement Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization, Karaj, Iran
نخود (Cicer arietinum) یکی از مهمترین حبوبات است که حساس به سرما بوده و هر ساله کاهش ناگهانی دما منجر به افت عملکرد قابل توجه آن میشود. ریزRNAها، RNAهای کوچک غیررمزکننده بسیار محافظت شده ای هستند که بیان ژن را با تخریب mRNAهای هدف پس از رونویسی یا سرکوب ترجمه آنها تنظیم میکنند و نقش آنها در پاسخ به سرما در گیاهان مختلف به اثبات رسیده است. در این مطالعه، به منظور شناسایی ریزRNAهای پاسخ دهنده به سرما، پس از توالی یابی ترانسکریپتوم در یک رقم متحمل (سارال) و یک لاین حساس به تنش سرما (ILC۵۳۳)، توالی ژنهای پاسخ دهنده به تنش سرما در نخود با استفاده ازنرم افزار c-mii مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. سپس، ژنهای هدف تعدادی از ریزRNAهای مهم با استفاده از نرمافزار psRNA Target تعیین شدند. نتایج نشان داد که ۳۰ ریزRNA در ژنوتیپ متحمل و ۲۰ ریزRNA در ژنوتیپ حساس نخود به تنش سرما پاسخ دادند. با مقایسه پاسخ ریزRNAها در دو ژنوتیپ مورد بررسی، ریزRNAهایmiR۱۵۹ ،miR۳۱۹ ، miR۳۹۳ و miR۳۹۴ به عنوان ریزRNAهای نامزد دخیل در تحمل سرما در نخود تعیین و نقش آنها مورد بررسی دقیق تر قرار گرفت. امید است نتایج به دست آمده در راستای ایجاد ارقام نخود متحمل به سرما مفید واقع شود.
کلمات کلیدی: Cicer arietinum, small noncoding RNAs, Cold responsive, Target genes, نخود زراعی, پاسخ دهنده به سرما, RNA های کوچک غیررمزده, ژن های هدف
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1617727/