ارزیابی تنوع ژنتیکی در ژنوتیپ های کینوا (.Chenopodium quinoa Willd) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
عنوان مقاله: ارزیابی تنوع ژنتیکی در ژنوتیپ های کینوا (.Chenopodium quinoa Willd) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
شناسه ملی مقاله: JR_AGRO-24-4_005
منتشر شده در در سال 1401
شناسه ملی مقاله: JR_AGRO-24-4_005
منتشر شده در در سال 1401
مشخصات نویسندگان مقاله:
ابراهیم سوری لکی - University of Guilan, Rasht, Iran
بابک ربیعی - University of Guilan, Rasht, Iran
وحید جوکار فرد - University of Guilan, Rasht, Iran
حسن مرعشی - Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran
خلاصه مقاله:
ابراهیم سوری لکی - University of Guilan, Rasht, Iran
بابک ربیعی - University of Guilan, Rasht, Iran
وحید جوکار فرد - University of Guilan, Rasht, Iran
حسن مرعشی - Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran
به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی جهت استفاده در تحقیقات بعدی، در این پژوهش تنوع ژنتیکی ۶۰ ژنوتیپ کینوا وارداتی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره در سال ۱۴۰۰ در دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج ارزیابی های فنوتیپی ژنوتیپهای کینوا نشان داد که تنوع نسبتا بالایی در بین آنها وجود داشت که در بین صفات مورد بررسی بهترتیب صفات عملکرد دانه در بوته (۸/۴۲) و تعداد روز تا خمیری شدن دانه (۱۴/۸) بیشترین و کمترین مقدار ضریب تغییرات فنوتیپی را داشتند. ارزیابی تنوع مولکولی ژنوتیپها با استفاده از ۴۰ جفت نشانگر ریزماهواره، تعداد ۱۳۶ باند چندشکل تولید کرد و میانگین تعداد آلل های موثر (۸۱/۱)، محتوای اطلاعات چندشکلی (۶۰/۰)، شاخص شانون (۵۴/۰) و تنوع ژنی نی (۴۴/۰)، وجود تنوع بالا در بین ژنوتیپهای کینوا را مورد تایید قرار داد. نشانگرهای KAAT۰۲۷، KAAT۰۳۶، KAAT۰۴۰، KCAA۰۱۴، KGA۰۴۲، KGA۰۵۵ و KGA۰۵۹ با پنج آلل چندشکل، بیشترین تعداد آلل چندشکل را در بین نشانگرهای مورد استفاده داشتند. میانگین تعداد آللهای موثر نشانگرهای ریزماهواره در ژنوتیپهای کینوا ۸۱/۱ آلل بود و نشانگرهای KAAT۰۲۷ و KAAT۰۰۶ با ۷۵/۳ و ۰۸/۱ آلل،
بهترتیب بیشترین و کمترین تعداد آلل موثر را نشان دادند. تجزیه خوشهای با استفاده از روش UPGMA، ۶۰ ژنوتیپ کینوا را در دو زیرجمعیت با ۳۸ و ۲۲ ژنوتیپ گروهبندی کرد. با توجه به اینکه یکی از معیارهای مهم در انتخاب نشانگرهای مناسب و سودمند، تعداد آلل موثر است، بنابراین میتوان از نشانگرهای با تعداد آلل موثر بیشتر شامل KAAT۰۲۷، KAAT۰۳۶ و KAAT۰۴۰ (هر سه با بیش از سه آلل موثر)، برای بررسی تنوع ژنتیکی در ژنوتیپهای کینوا در پژوهشهای آتی استفاده کرد.
کلمات کلیدی: Cluster analysis, Microsatellite markers, Polymorphic information content, Population structure and Quinoa, تجزیه خوشه ای, ساختار جمعیت, کینوا, محتوای اطلاعات چندشکل و نشانگر ریزماهواره
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1647953/