همسانه سازی و بررسی تبارزایی جدایه های ایرانی narcissus latent virus براساس ترادف نوکلئوتیدی ناحیه ’۳ ژنوم
عنوان مقاله: همسانه سازی و بررسی تبارزایی جدایه های ایرانی narcissus latent virus براساس ترادف نوکلئوتیدی ناحیه ’۳ ژنوم
شناسه ملی مقاله: JR_JPP-36-4_002
منتشر شده در در سال 1401
شناسه ملی مقاله: JR_JPP-36-4_002
منتشر شده در در سال 1401
مشخصات نویسندگان مقاله:
زهره مرادی - گروه گیاهپزشکی، دانشکده علوم زراعی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
محسن مهرور - گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، خراسان رضوی
خلاصه مقاله:
زهره مرادی - گروه گیاهپزشکی، دانشکده علوم زراعی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
محسن مهرور - گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، خراسان رضوی
ویروس نهفته نرگس (narcissus latent virus, NLV) یکی از بیمارگرهای بسیار مهم و خسارتزای ارقام تجاری گیاه نرگس و زنبق در سراسر جهان میباشد. به منظور شناسایی این ویروس، گیاهان زنبق با علائم مشکوک ویروسی از شمال شرق کشور جمع آوری و ناحیه ´۳ ژنوم آنها با استفاده از آغازگرهای اختصاصی با روش رونویسی معکوس و واکنش زنجیرهای پلیمراز (RT-PCR) تکثیر و همسانهسازی شد. ناحیه CP-UTR این جدایهها (سه جدایه) به همراه تعدادی از ترادفهای جدایههای موجود در بانک ژن (۲۴ جدایه) مقایسه و پس از انجام همردیفسازی چندگانه، مورد تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی قرار گرفتند. جدایههای مورد مقایسه در درخت فیلوژنتیکی در دو گروه جداگانه قرار گرفتند ( I وII ) و جدایههای ایرانی در کنار جدایههایی از لهستان، نیوزیلند، و بریتانیا در گروه II قرار گرفتند. مقایسه درصد مشابهت ژنتیکی نشان داد که جدایههای ایرانی با سایر جدایههای NLV بین ۴۷/۷۷ تا ۱۲/۹۸ درصد در سطح نوکلئوتیدی مشابهت دارند که به ترتیب بیشترین میزان شباهت (بین ۶۵/۹۷ تا ۱۲/۹۸ درصد) با جدایه NLV۵_۱ (JX۲۷۰۷۶۶) از لهستان و کمترین (بین ۴۷/۷۷ تا ۹۵/۷۷ درصد) با جدایه NLV۳ (JX۲۷۰۷۶۲) از لهستان بود. همچنین تشابه توالی نوکلئوتیدی و آمینواسیدی سه جدایه ایرانی با یکدیگر به ترتیب ۸۴/۹۷-۹۷ و ۰۲/۹۹-۳۸/۹۷ درصد تعیین گردید. میزان تنوع نوکلئوتیدی ناحیه CP-UTR بین جدایههای NLV، ۱۳۰/۰ به دست آمد که نشان دهنده تنوع ژنتیکی بالای این ویروس در این ناحیه از ژنوم است. نتایج پژوهش حاضر میتواند در برنامههای بهنژادی مولکولی برای تولید ارقام مقاوم به ویروس مفید بوده و خسارت ناشی از بیماری را کاهش دهد.
کلمات کلیدی: آنالیز تبارزایی, ناحیهCP-UTR, ویروس نهفته نرگس, همسانه سازی, ایران
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1676924/