حسین محمدی - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک، اراک، ایران
محمد شمس اللهی - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران

پاراتوبرکلوزیس یا بیماری یون (JD) یکی از بیماری­های مهم مزمن التهاب روده­ای در نشخوارکنندگان است. هدف پژوهش حاضر، شناسایی نشانه­های انتخاب با استفاده از آماره نااریب تتا مرتبط با مقاومت به بیماری یون در دو نژاد بز جانیکا و سیریانا می­باشد. به این منظور، مجموع ۳۳۱ حیوان برای ۵۳۳۴۵ جایگاه نشانگری SNP با استفاده از تراشه­های Caprine SNP۵۰ BeadChip تعیین ژنوتیپ شدند. پس از کنترل کیفیت داده­های اولیه در نهایت، ۵۱۱۸۲ نشانگر SNP و ۳۲۶ راس دام وارد آنالیزهای بعدی شدند. حیوانات مورد استفاده بر اساس آزمون آنتی­بادی سرم خون (الایزا) در دو دسته مقاوم به بیماری یا سالم (۱۶۲) و بیمار (۱۶۴) گروه­بندی شدند. با در نظر گرفتن صدک ۹/۹۹ کل ارزش­های تتا، سیزده ناحیه ژنومی در نژاد جانیکا روی کروموزوم­های ۱، ۵، ۷ (دو منطقه)، ۸، ۹ (دو منطقه)، ۱۱، ۱۶، ۱۷، ۱۸ و ۲۰ (دو منطقه) شناسایی شدند. همچنین، در نژاد سیریانا نواحی ژنومی روی کروموزوم­های ۳، ۵ (دو منطقه)، ۱۰، ۱۲، ۱۶، ۱۷، ۱۸، ۲۳، ۲۴ و ۲۹ بالاتر از این دامنه بودند، شناسایی شدند. بررسی ژن­های گزارش شده در این مناطق نشان داد که در داخل یا مجاورت این نواحی، ژن­های IL۴، IL۱۳، TLR۲، TLR۴، IFNGR۱، PGLYRP۱، CHI۳L۲، PPFIBP۱ و DENND۵B قرار داشتند. بررسی بیوانفورماتیکی این مناطق نشان داد، ژن­های موجود در این مناطق با سیستم ایمنی، مقاومت به بیماری و عفونت باکتریایی، پاسخ به استرس اکسیداتیو و سرکوب سرطان مرتبط هستند. نتایج این تحقیق می­تواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی در زمینه شناسایی مناطق ژنومی و در نتیجه، ژن­های مرتبط با بیماری یون در نژادهای مختلف بز فراهم آورد.

آماره تتا, بیماری یون, سیستم ایمنی, سیگنال های انتخاب