مطالعه ی بیوانفورماتیکی و تجربی بیان ژن های UBE۲Wو SSX۲IP در سلول های سرطانی HepG۲ تیمار شده با ملاتونین
عنوان مقاله: مطالعه ی بیوانفورماتیکی و تجربی بیان ژن های UBE۲Wو SSX۲IP در سلول های سرطانی HepG۲ تیمار شده با ملاتونین
شناسه ملی مقاله: JR_JMUMS-30-192_002
منتشر شده در در سال 1399
شناسه ملی مقاله: JR_JMUMS-30-192_002
منتشر شده در در سال 1399
مشخصات نویسندگان مقاله:
علی رجبی - PhD Student in Genetics, Faculty of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran
علی امامی - MSc in Genetics, Faculty of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran
بهناز برزگرزاده نمرور - MSc in Animal Physiology, Faculty of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran
رضا صفرعلیزاده - Associate Professor, Department of Animal Biology, Faculty of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran
خلاصه مقاله:
علی رجبی - PhD Student in Genetics, Faculty of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran
علی امامی - MSc in Genetics, Faculty of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran
بهناز برزگرزاده نمرور - MSc in Animal Physiology, Faculty of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran
رضا صفرعلیزاده - Associate Professor, Department of Animal Biology, Faculty of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran
سابقه و اهداف: هدف از مطالعه حاضر ارزیابی بیوانفورماتیکی و تجربی تاثیر ملاتونین بر بیان ژنهای UBE۲W و SSX۲IP در رده سلولی HepG۲ تیمار شده با داروی ملاتونین میباشد. UBE۲W پروتئینی را رمزگذاری می کند که باعث افزایش یوبیکویتینه شدن پروتئینهای گروه مکمل آنمی فانکونی شده و ممکن است در ترمیم آسیب DNA مهم باشد. SSX۲IP متعلق به سیستم اتصال سلولی است که در حرکت سلول دخیل است و به عنوان یک عامل بلوغ سانتروزوم عمل می کند.
مواد و روشها: در ابتدا، نرم افزار MATLAB ۲۰۱۸a برای ارزیابی میزان بیان ژنهای UBE۲W و SSX۲IP از دادههای میکرو آرایه مورد استفاده قرار گرفت. سپس، بعد از طراحی و تهیه پرایمرها، آزمایشات تجربی شامل تست MTT و Real-time PCR انجام گرفت.
یافته ها: نتیجه تست MTT نشان داد که زنده مانی سلول مورد مطالعه در گروه تیمار شده با ملاتونین بصورت معنی داری کاهش می یابد و میزان IC۵۰ برای ۴۸ ساعت برابر ۴۵۰ میکرومولار تخمین زده شد. نتایج Real-time PCR ثابت کرد که میزان بیان هر دو ژن مورد مطالعه در سلولهای تیمار شده با ملاتونین در مقایسه با گروه شاهد افزایش ( غیر معنیدار p≥ ۰.۰۵ در ۲۴ ساعت و معنیدار p≤۰.۰۵ در ۴۸ ساعت) می یابد که هم راستا با نتایج آنالیز بیوانفورماتیکی میباشد.
استنتاج: نتایج این مطالعه نشان میدهد که UBE۲W و SSX۲IP میتوانند به عنوان ژن هدف در درمان هپاتوسلولار کارسینوما به کار گرفته شود، اگر چه برای تایید این نتایج نیاز به انجام مطالعات گسترده میباشد.
کلمات کلیدی: melatonin, Hepatocellular carcinoma, bioinformatics, microarray data, ملاتونین, کارسینومای هپاتوسلولار, بیوانفورماتیک, داده های میکرو آرایه
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1784630/