پویش ژنومی نشانه های انتخاب در گوسفندان پوستی و پشمی ایرانی با استفاده از روش های برآوردگر نااریب FST و hapFLK
عنوان مقاله: پویش ژنومی نشانه های انتخاب در گوسفندان پوستی و پشمی ایرانی با استفاده از روش های برآوردگر نااریب FST و hapFLK
شناسه ملی مقاله: JR_ARGU-12-2_007
منتشر شده در در سال 1402
شناسه ملی مقاله: JR_ARGU-12-2_007
منتشر شده در در سال 1402
مشخصات نویسندگان مقاله:
زهرا پتی آبادی - دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان
محمد رزم کبیر - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان
علی اسمعیلی زاده کشکوئیه - استاد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
محمدحسین مرادی - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه اراک
امیر رشیدی - استاد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان
خلاصه مقاله:
زهرا پتی آبادی - دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان
محمد رزم کبیر - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان
علی اسمعیلی زاده کشکوئیه - استاد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
محمدحسین مرادی - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه اراک
امیر رشیدی - استاد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان
بررسی نشانههای انتخاب در کل ژنوم به شناسایی ساز و کارهای انتخاب و تشخیص مناطقی از ژنوم که طی سالیان متمادی بهصورت طبیعی و یا مصنوعی انتخاب شدهاند، کمک میکند. هدف از این پژوهش، شناسایی نقاطی از ژنوم در گوسفندان پوستی و پشمی بود که طی سالهای مختلف انتخاب شدهاند. بدین منظور، ۸۰ راس گوسفند پوستی (قرهگل، سیاهکبود و کبودهشیراز) و پشمی (سنجابی، کرمانی و بلوچی) با استفاده از آرایههای گوسفندیk ۶۰۰ تعیین ژنوتیپ شدند. برای شناسایی نشانههای انتخاب از آزمون نااریبFST (تتا) و آزمون hapFLK استفاده شد .نتایج تتا، ۲۶ منطقه ژنومی روی کروموزومهای ۱، ۲، ۶، ۱۹ و ۲۴، و نتایج hapFLK، هفت منطقه ژنومی روی کروموزومهای ۶ و ۱۹ شناسایی کرد. تجزیه و تحلیل اطلاعات زیستی (بیوانفورماتیکی) نشان داد که برخی از این مناطق ژنومی با ژنهای موثر بر صفات رنگدانه و مشخصات پشم (KIT، MITF، IGSF۱۰ و PDGFRA)، عضلات (MICALL۲)، اتساع عروق و پاسخ ایمنی (P۲RY) و سرطان (MIR۳۳۹، ELFN۱، MAD۱L۱ و GPR۸۷) همپوشانی دارند. بررسی QTLهای گزارش شده نیز نشان داد که این مناطق با QTLهای صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با مشخصات گوشت، لاشه، شیر، وزن بدن، تراکم استخوان و تعداد کل برههای متولد شده در ارتباط هستند. همچنین نواحی مورد انتخاب با مسیرهای درگیر در تمایز ملانوسیت و رنگدانهها، تمایز سلولهای بنیادی، فرآیندهای سلولی، توسعه سیستم ایمنی، سیستم خونی، فرآیندهای باروری و سلولی ارتباط داشتند. به هر حال، برای شناسایی نقش دقیق ژنها و QTLهای شناسایی شده، لازم است مطالعات تکمیلی انجام گیرد.
کلمات کلیدی: آزمون تتا, آزمون hapFLK, پویش ژنومی, گوسفندان ایرانی, نشانه های انتخاب
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1820452/