بررسی ردپای انتخاب و هستی شناسی ژن در برخی نژاد های گوسفند اهلی و وحشی ایران
عنوان مقاله: بررسی ردپای انتخاب و هستی شناسی ژن در برخی نژاد های گوسفند اهلی و وحشی ایران
شناسه ملی مقاله: JR_JASR-15-4_008
منتشر شده در در سال 1402
شناسه ملی مقاله: JR_JASR-15-4_008
منتشر شده در در سال 1402
مشخصات نویسندگان مقاله:
مجید بی غم - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران.
محمدرضا نصیری - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران.
مهیار حیدرپور - دانشگاه علوم پزشکی هاروارد، دپارتمان پزشکی ، شهر بوستون، ایالت ماساچوست، آمریکا
علی جوادمنش - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران.
خلاصه مقاله:
مجید بی غم - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران.
محمدرضا نصیری - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران.
مهیار حیدرپور - دانشگاه علوم پزشکی هاروارد، دپارتمان پزشکی ، شهر بوستون، ایالت ماساچوست، آمریکا
علی جوادمنش - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران.
در طی سالیان طولانی، حیوانات در معرض عوامل مختلفی مانند انتخاب طبیعی، رانش ژنتیکی و جهشهای متعدد قرار گرفتهاند، بنابراین چنین عواملی سبب تغییرات در بین و داخل گونهها شده است. از سویی دیگر امروزه نیاز به افزایش تولید سبب کاهش تنوع ژنتیکی گونهها بوده که نگرانیهای شدیدی را برای سیستم تولیدی حیوانات در سراسر جهان به وجود آورده است. هدف از انجام این تحقیق، شناسایی مناطق ژنومی تحت انتخاب در گوسفندان اهلی در مقایسه با گوسفندان وحشی ایران و بررسی هستی شناسی ژنهای کاندید مرتبط با صفات اقتصادی میباشد. در این تحقیق، دادههای دو گروه گوسفند اهلی (۱۰۶ راس) و وحشی (۸ راس) بومی ایران بعد از ویرایش و کنترل کیفیت با نرم افزارهای R و Plink مورد آنالیز قرار گرفتند و نتایج حاصل با استفاده از سرورهای آنلاین DAVID، GeneCards و UniProtKB تفسیر شدند. نتایج نهایی نشان دادند، ۹۵ منطقه ژنومی روی ۲۳ کروموزوم در گوسفند وحشی و اهلی با هم اختلاف داشتند و بیشترین اختلاف روی کروموزومهای ۱۳ و ۷ بوده که به ترتیب با ژنهای ۱۴ و ۹ مرتبط میباشند. بررسی مناطق ژنومی دارای اختلاف در دو نژاد نشان دادند که این مناطق با صفات کیفیت و کمیت گوشت، شیر، چربی، استخوان (با فراوانی بالاتر در گونه اهلی) و سیستم ایمنی و مقاومت به انگل (با فراوانی بالاتر در گونه اهلی) مرتبط میباشند. برخی از ژنهای مهم شناسایی شده، شامل GABRB۱، GRM۳، HERC۱، HERC۳ و KCND۲ بودند. در بررسی هستی شناسی ژنها، مسیرهای زیستی شناسایی شده مربوط به کانالهای عبور یون ها از غشای سلولی، فرآیندهای تحریک عصبی عضلات، رشد مغز و مخچه، انتقال غشایی یون های غیر آلی بود. مشخص نمودن صفات مهم اقتصادی و مکانیابی بخش هایی از ژنوم که در اثر انتخاب تغییر پیدا کردهاند، میتواند در برنامههای اصلاح نژادی گوسفند در کشور مورد استفاده قرار گیرد.
کلمات کلیدی: صفات اقتصادی, گوسفند اهلی, گوسفند وحشی, نشانه انتخاب, هستی شناسی
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1875387/