ارائه متدولوژی و طراحی کاشی های خودسامانی مبتنی بر دنا جهت انجام محاسبات موازی

محاسبات مولکولی پدیده ای نوظهور از محاسبات در مقیاس نانو متری می باشد. تمرکز محاسبات مولکولی طراحی و ساخت پردازشگرهای مولکولی بر بستری از ماکرومولکولهای زیستی مانند دیاکسیریبونوکلئوتیداسید ، ریبونوکلئوتیداسید و پروتئینها میباشد [۱]. محاسبات دنا زیر شاخه ای از محاسبات مولکولی است که از واکنش شیمیایی بین رشته های دنا برای انجام محاسبات استفاده میکند. این محاسبات از نظر مقیاسپذیری، سادگی انجام و ساخت، هزینه های طراحی و پیاده سازی و ... تابحال موفقترین روش از بین همه روشهای شناخته شده برای محاسبات مولکولی میباشد [۲].مدل های محاسباتی گوناگون با کاربردهای مختلف مبتنی بر رشته های دنا تا به امروز ارائه شده است، از جمله این مدل های محاسباتی، مدل محاسباتی خودسامانی می باشد. این مدل محاسباتی با توجه به قدرت خودسامانی کاشی ها، توان موازی سازی بسیار بالا و قاعده مند بودن آن بسیار مورد توجه قرار گرفت. با وجود این مزایا چالش هایی نظیر عدم کنترل پذیری کاشی ها و درصد خطای بالا و ایجاد کریستال های بزرگ در خروجی نهایی مانع پیشرفت این روش شده است. با حل مشکل کنترل پذیری کاشی ها در [۲]، امکان ارائه مدل مناسبی برای ساخت توابع منطقی با استفاده از این روش فراهم شده است. در این مقاله روشی برای طراحی توابع منطقی توسط کاشی های خودسامانی ارائه شده است. علاوه بر این قابلیت گسترش و کاهش هزینه های ساخت و همچنین توسعه روش برای ایجاد روند طراحی خودکار در این مقاله ارائه شده است. متدولوژی معرفی شده در این مقاله می تواند سرآغاز امید بخشی برای انجام محاسبات به صورت موازی باشد.

Keywords:

محاسبات مبتنی بر دنا , کاشی های خودسامانی , روش طراحی دوخطی , مدل های محاسباتی , محاسبات موازی.