تجزیه و تحلیل ترجیح کدونی ژن های رمز کننده H+ - ATPase غشای پلاسمایی در Arabidopsis thaliana
Publish place: 3rd Iranian Agricultural Biotechnology Conference
Publish Year: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 480
متن کامل این Paper منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل Paper (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
AGRIBIOTECH03_050
تاریخ نمایه سازی: 27 تیر 1392
Abstract:
به منظور بررسی ترجیح کدونی در ایزوفر مهای مختلف ژن H+-ATPase غشای پلاسمایی در آرابیدوپسیس، توالی ژنومی مربوط به 11 ایزوفرم مختلف این ژن از سایت TAIR گرفته شد. از سایت Gene Infinity برای تجزیه و تحلیل کدون های مترادف این ژن، استفاده شد. نتایج نشان داد که بیشترین تعداد کدون در 2AHA با 982 عدد و کمترین کدون در 5AHA با 932 عدد وجود دارد. همچنین نتایج نشان داد که در اسید آمین ههای مختلف بیشترین میانگین فراوانی مربوط به کدو نهایی بود که انتهای آن ها U بود و کمترین میانگین فراوانی مربوط به کدون هایی بود که انتهای آن ها G بود. همچنین بررسی کدون های مترادف نشان داد که که بین فراوانی بعضی از کدون ها از نظر آماری در سطح 5٪ همبستگی وجود دارد. برای مثال در آلانین بین فراوانی کدون های GCC و GCG با ضریب همبستگی 0/733 - = r رابطه عکس وجود دارد. در لوسین بین فراوانی کدو نهای UUG و CUA با ضریب همبستگی 0/753 = r رابطه مستقیم وجود دارد. نتایج نشان داد که بین ایزوفرم های مختلف یک ژن از نظر ترجیح کدونی تفاوت وجود دارد.
Keywords:
Authors
محسن جم
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
محمد فاضل سلطانی
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
عباس عالم زاده
استادیار بخش زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :