CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

آنالیر عوامل رونویسی و پیش بینی مولفه های ساختاری ژن های سازنده آنزیم امگا 6 فتی اسید دی سچوراز

عنوان مقاله: آنالیر عوامل رونویسی و پیش بینی مولفه های ساختاری ژن های سازنده آنزیم امگا 6 فتی اسید دی سچوراز
شناسه ملی مقاله: AGRIBIOTECH03_080
منتشر شده در سومین همایش ملی بیوتکنولوژی کشاورزی ایران (گیاهی، دامی و صنعتی) در سال 1391
مشخصات نویسندگان مقاله:

مرتضی رضوی - کارشناس زیست شناسی دانشگاه پیام نور
علی سالاری - دانشجوی کارشناسی زیست شناسی دانشگاه پیام نور قم
حسین موسوی - کارشناس زیست شناسی دانشگاه پیام نور قم
منصور ابراهیمی - گروه پژوهشی بیوانفورماتیک، پژوهشکده سبز دانشگاه قم

خلاصه مقاله:
آنزیم امگا 6 فتی اسید ، آنزیمی دی سچوراز و غیر اشباع کننده است که باعث اضافه شدن دومین پیوند دوگانه به زنجیره اسید چرب 20 کربنه ی امگا 3 و امگا 6 می شود. مهمترین ماتریکس ها و خانواده های فاکتورهای رونویسی توسط ابزار های بیوانفورماتیکی که در رونویسی ژن Omega-6 Fatty Acid Desaturase FAD6 نقش دارند نیز تعیین شد . و فاکتورهای رونویسی جهت پیدا کردن کاندیدی احتمالی که تا به حال در مقاله ای ثبت نشده باشد جستجو شد. با استفاده از ابزارهای مدل سازی و برنامه های مختلف داده کاوی نسبت به طراحی بانک اطلاعاتی از متغیرهای ژنی حدود 110 فستای ژنی آنزیمهای فوق در گونه های مختلف اقدام شده و سپس با استفاده از مدلهای وزن دهی، درخت های تصمیم گیری و روشهای دسته بندی نسبت به شناسایی مهمترین متغیرها اقدام شد. در نهایت برای اولین بار طراحی مدل های پیش بینی نوع ارگانیزم بر اساس متغیرهای ژنی انجام شد.سپس با استفاده از دیتا بیس های ژنی تحت وب ، حدود 110 ژنی که سازنده ی آنزیم استریول کو آنزیم آ در تمام موجودات است ، جمع آوری شد و با استفاده از مدل های پیش بینی وب سایت های ژنتیکی ، فاکتورهای رونویسی که بیشترین شباهت را با پروموتر ژن های سازنده ی این آنزیم داشتند پیش بینی شدند و بر اساس نوع ماتریکس و خانواده ی فاکتور های رونویسی دسته بندی شدند مهمترین متغیر ژنی در تشخیص ساختارهای ارگانیزمی آنزیم FAD6 مولفه ی تعداد نوکلئوتید های گوانین و تیمین که به ترتیب به هم متصل اند GT بوده است. همچنین مدلهای پیش بینی طراحی شده نشان دادند که مدل شبکه ی عصبی Neural Net با دقت 97.75% می تواند ارگانیزم آنزیمهای جدید را بر اساس خصوصیات ژنی پیش بینی نماید.

کلمات کلیدی:
Omega-6 Fatty Acid Desaturase ، امگا 6 فتی اسید دی سچوراز ، FAD6 ، . امگا 3 و امگا

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/204132/