جداسازی، تعیین خصوصیت و تحلیل بیان ژن ۴’OMT۲ گیاه دارویی شقایق
عنوان مقاله: جداسازی، تعیین خصوصیت و تحلیل بیان ژن ۴’OMT۲ گیاه دارویی شقایق
شناسه ملی مقاله: JR_IJRFP-26-2_002
منتشر شده در در سال 1397
شناسه ملی مقاله: JR_IJRFP-26-2_002
منتشر شده در در سال 1397
مشخصات نویسندگان مقاله:
S. M. Sohrabi - دانشجوی دکتری، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد
A. Ismaili - نویسنده مسئول مکاتبات، دانشیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد پست الکترونیک: ismaili.a@lu.ac.ir
F. Nazarian Firouz-Abadi - استاد، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد
K. Samiei - دانشجوی دکتری، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد
خلاصه مقاله:
S. M. Sohrabi - دانشجوی دکتری، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد
A. Ismaili - نویسنده مسئول مکاتبات، دانشیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد پست الکترونیک: ismaili.a@lu.ac.ir
F. Nazarian Firouz-Abadi - استاد، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد
K. Samiei - دانشجوی دکتری، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد
DOR: ۹۸.۱۰۰۰/۱۷۳۵-۰۸۹۱.۱۳۹۷.۲.۱۶۵.۵۲.۲۶.۱۵۸۰.۳۲ گیاه شقایق (Papaver somniferum L.) یکی از مهمترین گیاهان دارویی جهان بوده و چندین آلکالوئید بنزیل ایزوکوئینولینی دارویی مهم را تولید می کند. در این پژوهش ژن ۴’OMT۲ (۳′-hydroxy-N-methylcoclaurine ۴′-O-methyltransferase) از این گیاه جداسازی، تعیین توالی و تعیین خصوصیت شد. پس از تکثیر توالی کدکننده و ژنومیک ژن ۴’OMT۲با استفاده از PCR، این قطعات در پلاسمید pTZ۵۷R/T همسانهسازی و تعیین توالی شدند. نتایج توالی یابی قطعاتی با طول ۱۰۷۴ و ۱۱۸۹ جفت بازی را بهترتیب برای توالی کدکننده و ژنومیک نشان داد. برای اولین بار در این گیاه، نتایج وجود یک اینترون با طول ۱۱۵ جفت باز را در توالی ژنومیک ژن ۴’OMT۲نشان داد. ژن جداسازی شده از ژنوتیپ ایرانی با همسانی بسیار بالایی به ژن ۴’OMT۲جنس شقایق شباهت داشت و با همسانی بیشتر از ۶۷ درصد به گیاهان راسته آلاله سانان شبیه بود. بررسی های بیوانفورماتیکی بیشتر نشان داد که ژن ۴’OMT۲آنزیمی پایدار را تولید می کند که بدون سیگنال پپتید بوده و در سیتوپلاسم تجمع پیدا می کند. برای بررسی آنالیز بیان ژن، پنج کتابخانه از داده های SRA (نوع mRNA) گیاه شقایق مربوط به ترانسکریپتوم جوانه گل، برگ، میوه در حال نمو، ساقه و ریشه از پایگاه SRA دریافت و بیان ژن جداسازی شده ۴’OMT۲در آنها با استفاده از نرمافزار IDEG۶ و آزمون های آماری بررسی شد. نتایج نشان داد که این ژن دارای بیان متفاوتی در بافت های مختلف گیاه شقایق بوده و بیشترین میزان بیان را در بافت ساقه دارد. شناسایی توالی کدکننده ژن های بیوسنتزی و بررسی خصوصیات آنها اولین قدم در دستورزی ژنتیکی و بهرهگیری در مهندسی متابولیک است. در این پژوهش برای اولین بار توالی کدکننده کامل ژن ۴’OMT۲از گیاه شقایق جداسازی شد و وجود یک اینترون در ساختار آن مشخص و اثبات شد.
کلمات کلیدی: بیان ژن, O- متیل ترانسفراز, توالی ژنومیک, شقایق, SRA
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/2076370/