بررسی مسیرهای سیگنالی متابولیسمی در سلول های بنیادی سرطان گلیوبلاستوما به واسطه آنالیز های بیوانفورماتیک

مقدمه:  گلیوبلاستوما یکی از سرطان های شایع مغزی بوده که نرخ مرگ و میر بالایی دارد. در این مطالعه با استفاده از آنالیز بیوانفورماتیک به بررسی و کاندید نمودن ژن های موجود در مسیرهای متابولیسمی سلول های بنیادی گلیوبلاستوما پرداخته شد. روش کار: در این مطالعه با مراجعه به پایگاه داده GEO دیتاست مناسب برای آنالیز انتخاب گردید. این دیتاست شامل پروفایل بیان ژنی در سلول های بنیادی جدا شده از بیماران گلیوبلاستوما بود. کلاسترهای ژنی با بیان بالا و پایین دسته بندی شدند. برای ارزیابی دقیق تر داده از پایگاه های داده غنی همچون Enrichr، STRING و GEPIA استفاده شد. در نهایت ژن هایی کاندید و جدا شدند. یافته ها: ۱۲۵۰ ژن در مسیر های بیوسنتز کلسترول، متابولیسم اینوزیتول تری فسفات، متابولیسم گرانیل گرانیل دی فسفات، بیوسنتز زیموسترول و متابولیسم فسفاتیدیل اینوزیتول بیان بالا داشته و ۱۰۳۰ ژن در مسیرهای کوندروییتین سولفات، درماتان سولفات، N استیل گلوکوزآمین، مسیر گلیکولیز بیان پایین داشتند. پس از ارزیابی ارتباط بین شبکه های پروتئینی، ژن های با بیان بالا و ژن های با بیان پایین انتخاب شدند. تمامی این ژن ها در منحنی بقاء، در بازه حدود ۲۰ ماه، زنده مانی بیماران کمتر از ۱۰% مشاهده شد. نتیجه گیری: نتایج این مطالعه نشان داد که ژن  DHCR۷ به طور معنی داری افزایش بیان داشته و ژن ENO۲ نیز به طور معنی داری کاهش بیان داشته و بقیه ژن ها افزایش بیان و کاهش بیان نسبی داشتند.

Keywords:

Glioblastoma , Cancer Stem Cells , Gene Expression Profiles , Bioinformatics Analysis , گلیوبلاستوما , سلول های بنیادی سرطانی , پروفایل بیان ژن و آنالیز بیوانفورماتیک