انطباق ساختارهای RNA با استفاده از مدل های مخفی مارکوف
Publish place: 11th Intelligent Systems Conference
Publish Year: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 861
This Paper With 8 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
ICS11_176
تاریخ نمایه سازی: 14 مهر 1392
Abstract:
یکی از روش های تعیین شباهت و مقایسه ی دو ساختار - RNA ، انطباق آنها می باشد. در این مقاله یک روش مبتنی بر مدل مخفی مارکوف برای انطباق ساختارهای دوم RNA پیشنهاد می گردد. در این مدل توالی های مختلف RNA از خانوادههای مختلف با یکدیگر مقایسه شده و میزان شباهت آنها با یکدیگر سنجیده می شود. برای تخمین پارامترهای مدل از الگوریتم ME استفاده می شود، الگوریتم EM الگوریتم استانداردی برای بیشینه کردن پارامترهای HMM میباشد. نتایج بدست آمده نشان می دهند که مدل های مخفی مارکوف علاوه بر انطباق ساختارهای اول RNA ، ساختارهای دوم RNA را نیز با دقت بالایی انطباق می دهند. بنابر نتایج بدست آمده RNA های عضو خانواده ی HDV با صحت 83.33 % و SP برابر 89%و SN برابر 98 % و RNA های عضو خانواده ی PURINE با صحت 56 % و SP برابر76% و SN برابر 76 % مطابقت داده شدند
Keywords:
Authors
نیر مستقیم بخشایش
دانشکده مهندسی برق، دانشگاه صنعتی سهند
موسی شمسی
دانشکده مهندسی برق، دانشگاه صنعتی سهند
حسین ابراهیم نژاد
دانشکده مهندسی برق، دانشگاه صنعتی سهند
محمدحسین صداقی
دانشکده مهندسی برق، دانشگاه صنعتی سهند
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :