انگشت نگاری ژنتیکی جدایه های Xanthomonas با کمک روش REP-PCR

جنس Xanthomonas از گونه های باکتری های بیماری زای گیاهی تشکیل شده است که سبب بیماری در گیاهان مختلف و محصولات کشاورزی می شود. از طرف دیگر، اکثر گونه ها صمغ زانتان را از طریق فرایند تخمیر هوازی تولید می نمایند. در این مطالعه مابه انگشت نگاری ژنتیکی جدایه های Xanthomonas با استفاده از تکنیک REP-PCR پرداختیم. کل DN ژنومی با روش فنل-کلرفرم استخراج گردید. واکنش زنجیره ای پلی مراز (PCR) با کمک پرایمرهای ویژه ی (Repetitive Extragenic Pahimdromic Sequence(REP انجام شد. محصولات حاصل از PCR روی ژل آگاروز 1.5 درصد بارگذاری شد و پس از رنگ آمیزی ژل آگاروز با اتیدیوم بروماید توسط دستگاه ترانس لومیناتور با کمک نور UV مشاهده شد. نتایج نشان داد که جدایه های Xanthomonas الگوهای ژنتیکی متفاوتی را به نمایش می گذارند. با بررسی همه باندهای بدست آمده معلوم شد، بعضی باندها در همه ی سویه ها مشاهده می شوند و برخی منحصر به سویه ی خاصی است و این نشان دهنده ی تفاوت ژنوتیپ ها در میان این سویه ها است. در واقع این الگوی نواربندی متفاوت نشان دهنده ی تنوع ژنتیکی و بازتابی از پلی مورفیسم بین این گونه ها می باشد و معیار مناسبی جهت دسته بندی این گونه ها می باشد. بنابراین، با صرف وقت و هزینه اندک می توان به پلی مورفیسم ژنتیکی بین این جدایه ها پی برد.

Keywords:

, Zanthomonas , REP-PCR , انگشت نگاری ژنتیکی