آنالیز بیوانفورماتیک خانواده های ژنی دفاع اکسیداتیو در گیاه برنج

گیاهان مکانیسمهای مهمی را برای مقابله با اثرات مضر تولید ROS ها در خود توسعه داده اند ROS ها انواع اکسیژنهای شرکت کننده در واکنشها به عنوان مواد جهش زا عمل می کنند و تخریب چربی ها و غیر فعال کردن پروتئینهای اختلال در عمل آنها را سبب می شوند. ROSها شامل رادیکالهای آزاد اکسیژن و دیگر ترکیبات اکسیژن می باشند. آنتی اکسیدانها موادی هستند که از تشکیل رادیکالهای آزاد در سلول ها جلوگیری می کنند. هدف اصلی این پژوهش، شناسایی و بررسی ژنهای خانواده های آنتی اکسیدانی در ارتباط با شبکه دفاع اکسیداتیو گیاه برنج و انجام آنالیز بیوانفورماتیکی آنها است. درخت فیلوژنتیکی، گروهبندی و ژنهای هم بیان را به ما نشان می دهد. سپس المنتهای G-Box و skn-1-motif دارای بیشترین فراوانی به میزان 90.24 درصد می باشد که به ترتیب دارای توالیهای CACGTA و GTCAT می باشند. این درصد فراوانیها، وقوع تصادفی آنها را در نواحی پیشبر ژنهای مورد مطالعه کاهش می دهد. پیشنهاد می شود که جهت طراحی پروموتر و در طرحهای انتقال ژن در مهندسی ژنتیک در جهت تقویت شبکه دفاعی آنتی اکسیدانی گیاه در مقابله با تنشهای زنده و غیر زنده از عناصر حاوی توالیهای CACGTA و GTCAT استفاده گردد.

Keywords:

, ROS , آنتی اکسیدانها , آنالیز بیوانفورماتیک , پروموتر