بررسی تفاوت ژنوتیپهای مختلف توتون بر اساس نشانگرهای AFLP با استفاده از نرم افزار GGT: Graphical Genotypes
Publish place: 12th Congress of Iranian Genetics Society
Publish Year: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 663
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS12_0176
تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392
Abstract:
یکی از مهمترین اهداف به نژادگران شناسایی دقیق ژنوتیپهای برتر بر اساس خصوصیات ژنتیکی است و این امر مستلزم استفاده از راهکارهای مولکولی و بکارگیری نرم افزارهای آماری و ژنتیکی توانمند در این زمینه است. در این پژوهش از نشانگرهای AFLP و ترکیبهای مختلف آغاز گری EcoRI و MesI و نرم افزار (Graphical Ceno Types)GGT به عنوان ابزارهایی برای تشخیص ژنوتیپهای توتون و تمایز آنها استفاده شد. به این منظور ابتدا DNA ژنوتیپها استخراج و سپس مراحل مختلف روش AFLP اجرا شد. پس از تفکیک نوارهای DNA با استفاده از الکتروفورز محصولات نهایی واکنش زنجیرهای پلیمراز، امتیاز دهی نوارها به صورت صفر و یک به ترتیب برای حضور و عدم حضور نوار باندی انجام خواهد شد. تعداد پانزده جفت ترکیب آغاز گری تعداد 257 نوار چند شکل ایجاد نمود. پس از ثبت داده های ژنوتیپی و انتقال به نرم افزار GGT امکان نمایش گرافیکی ژنوتیپها از لحاظ کل ژنوم پوشش داده شده توسط نشانگرهای AFLP فراهم گردید. با استفاده از این تصویر گرافیکی مشخص شد ژنوتیپهای Burly7022, Burly151, GA.955, pafatzer, Hichs 55, Bel61-12, Bel71-501, Coker411 و Virgina Bright88 که همگی منشاء آمریکایی دارند از لحاظ بسیاری از نشانگرهای ترکیب آغاز گری E100-M150 عدم وجود نوار DNA را نشان دادند در حالیکه سایر ژنوتیپها تنها برای تعداد بسیار کمی از نشانگرهای این ترکیب آغازگری عدم وجود نوار DNA را آشاکر ساختند. انتظار می رود در صورتیکه بتوان برای تعداد بیشتری از ژنوتیپها با منشاء آمریکایی این نتیجه را اثبات نمود این تفاوتها در سطح DNA مربوط به خصوصیاتی باشد که این ژنوتیپها با منشاء امریکایی را از سایر ژنوتیپها متمایز می سازد
Keywords:
Authors
احمدرضا دادرس
گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید باهنر کرمان
قاسم محمدی نژاد
گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید باهنر کرمان
حسین صبوری
گروه تولیدات گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه گنبد کاووس
عاطفه صبوری
گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه گیلان
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :