CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

مطالعه روابط فیلوژنتیکی پکتیاز در نماینده گیاهان مدل تکلپه (Oryza Sativa) و دولپه (Arabidopsis Thaliana)

عنوان مقاله: مطالعه روابط فیلوژنتیکی پکتیاز در نماینده گیاهان مدل تکلپه (Oryza Sativa) و دولپه (Arabidopsis Thaliana)
شناسه ملی مقاله: CIGS12_0260
منتشر شده در دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران در سال 1391
مشخصات نویسندگان مقاله:

زهرا رشیدآبادی - دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
علی شوروزدی - دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه تبریز
سمیرا شاکری - دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

خلاصه مقاله:
دیواره سلولی گیاهان شامل سلولز، همیسلولز و پلی ساکاریدهای پکتیک است پکتین های موجود در دیواره سلولی بر اساس وزن مولکولی به سه دسته اسیدهای پکتیکی، اسیدهای پکتینیک و پروتوپکتینها تقسیم می شوند. آنزیمهای پکتیناز در گروه هیدرولازها قرار دارند و بروی مواد حاوی پکتین مؤثرنداند و بطور کلی به سه دسته پتین استراز، پلی گالاکتوروناز و پکتات لیاز طبقه بندی می شوند. برای بررسی روابط فیلوژنتیکی این آنزیم در دو گیاه برنج و آرابیدوپسیس تالیانا به عنوان نمایندگان گیاهان تکلپه و دولپه به ترتیب، با استفاده از ابزارهای سایت CAZY استخراج و clustalW انجام و مشخص شد که تعداد پروتئینهای پکتیناز در برنج 22 عدد می باشد که در 5 لاستر مختلف تقسیم شدند و تعدادآنها در آرابیدوپسیس تالیانا 50 عدد می باشد که به 6 کلاستر طبقه بندی می شوند. با مطالعه توالی های این دو گیاه مشخص شد که دوماینگهای GDDCV/IA/SI/L و SPNIDG در طول تکامل ثابت مانده اند که این ناظر بر این امر است ک ه این دوماینگ ها در فعالیت کینازها نقش کلیدی دارند همچنین مشخص شد که پکتیناز های آرابیدوپسیس از نظر تکاملی جلوتر از پتینازهای برنج به وجود آمده اند.

کلمات کلیدی:
دیواره سلولی، پکتین، دوماینگ، clustalW، فیلوژنتیک

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/226533/