توسعه نشانگرهای IRAP و REMAP جهت بررسی تنوع ژنتیکی در لاین های آفتابگردان (Helianthus annuus L)
Publish place: 12th Congress of Iranian Genetics Society
Publish Year: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 952
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS12_0314
تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392
Abstract:
رتروترنسپوزون ها عناصر رایج ژنوم گیاهان می باشند. فراوانی، فعالیت و توزیع مناسب رتروترنسپوزون ها در ژنوم، آنها را به یک ابزار مهم مطالعه ژنوم گیاهان تبدیل کرده است. به منظور بررسی سط تنوع ژنتیکی 106 لاین خالص آفتابگردان و فعالیت عناصر رتروترنسپوزونی، از نشانگرهای IRAP و REMAP استفاده شد. نتایج نشان داد که رتروترنسپوزون ها در ژنوم آفتابگردان فعال هستند و در داخل یکدیگر، و در نواحی نزدیک به ریزماهواره ها ادغام شده اند. از 36 آغاز گر منفرد و ترکیب آغازگری، 16 آغازگر (8 آغاز گر IRAP و 8 آغاز گر REMAP) قادر به تولید الگوی باندی با وضوح و چندشکلی بالا بودند. 16 آغازگر استفاده شده، در مجموع 155 مکان را تکثیر کرد که از این تعداد 128 مکان چند شکل بودند. ترکیب آغازگری 1065-1064 مبتنی بر رتروترنسپوزون های LTR به همراه 1061-UBC818 مبتنی بر رتروترنسپوزون LTR و نواحی ریزماهواره، بیشترین و آغازگر منفرد CF مبتنی بر رتروترنسپوزون Helicopia LTR کمترین تعداد مکان های چند شکل را تکثیر کردند. تجزیه کلاستر با روش Complete linkage و با استفاده از ضرایب تشابه دایس لاین ها را به 6 گروه تقسیم کرد. بیشترین مقدار تشابه ژنتیکی 0/96 بین لاین های H100B و HA340 و کمترین مقدار تشابه ژنتیکی 0/34 بین لاین های DM2 و 12*11 بود. مقدار متوسط تشابه ژنتیکی 0/73 بود.
Keywords:
Authors
اشکان بصیرنیا
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه ارومیه
رضا درویش زاده
استادیار گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه ارومیه
بابک عبدالهی مندولکانی
استادیار گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه ارومیه
علیرضا نبی پور
استادیار بخش تحقیقات اصلاح بذر معاونت موسسه تحقیقات برنج کشور، آمل
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :