شبیه سازی رایانه ای پیشبینی ساختار دوم توالی RNA با استفاده از مدلهای ترمودینامیکی
Publish place: 12th Congress of Iranian Genetics Society
Publish Year: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 1,496
This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS12_0629
تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392
Abstract:
امروزه ساختار دوم توالی مولکولهای RNA برای بسیاری از موجودات ساده شناسائی شده است. تعیین این ساختار در مسائل بیوانفورماتیک، علاوه بر تفسیر عملکرد و واکنش پذیری RNA، در تحلیل ساختار سوم مولکول RNA نیز کاربرد دارد. در این مقاله، یک برنامه با استفاده از نرم افزار رایانه ای MATLAB برای پیش بینی و نمایش دو بعدی ساختار دوم توالی RNA با کمترین انرژی آزاد به وسیله مدل ترمودینامیکی نزدیکترین همسایه (INN) طراحی شد. توالی t RNA مربوط به یک یوکاریوت از پایگاه داده بیوانفورماتیک استخراج شد و به عنوان ورودی برنامه مورد استفاده قرار گرفت. مدلهای ساختار دوم با حداقل انرژی آزاد در سه شکل نمودار برگی، نمودار با چهار انشعاب مجزا در محور مختصات و نمودار با استفاده از مدل برآمدگی و تو رفتگی به دست آمدند. از این نمودارها می توان در تلیل رایانه ای مسائل بیوانفورماتیک که به روش تفکیک داده های ژنتیکی به دو قسمت بالا و پائین آستان عمل می کنند، استفاده کرد.
Keywords:
Authors
کیوان آصف پور وکلیلیان
دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه اگروتکنولوژی، دانشگاه تهران
عبدالرضا صالحی
عضو هیئ علمی دانشگاه تهران
حامد ابراهیم زاده
دانشجوی کارنشاسی ارشد اصلاح گیاهان باغبانی، دانشگاه تهران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :