رسول محمدی نجف آبادی - دانشجوی دکترای اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس

به منظور بهینه سازی تولید پروتئین در سیستم های بیانی، تحلیل الگوی کدون های مترادف و تعیین کدون های بهینه بسیار مهم است. در این راستا کلروپلاست، به علت اندازه ژنوم کوچک و تعداد کپی برداری زیاد از اهمیت ویژه ای برخوردار است. از این رو پژوهش حاضر به تحلیل الگوی کدون های مترادف و تعیین کدون های بهینه در کلروپلاست گیاه برنج با استفاده از روش های چند متغیره آماری پرداخته است. نتایج حاصل از NC-plot نشان داد که اگر چه اکثر نقاط زیر منحنی مورد انتظار قرار گرفتند، ولی تعداد کمی از ژن ها بر روی منحنی واقع شدند. همچنین همبستگی معنی داری بین شاخص CAI و محور اول در آنالیز تطبیقی (r=0/612**) وجود داشت که نشان دهنده انحراف کدونی بیشتر در ژن های با سطح بیان بالاتر بود. در این تحقیق کدون های بهینه برای ژنوم کلروپلاست برنج نیز معرفی شد که این امر می تواند برای معرفی جهش های نقطه ای و تغییر ژن ها به منظور افزایش تولید پروتئین در مهندسی ژنتیک کلروپلاست، مفید و مؤثر باشد.

برنج، کلروپلاست، کدون مترادف، کدون بهینه