بررسی امکان استفاده از پلی مورفیسم ژن 16SrDNA کلروپلاستی در شناسایی و طبقه بندی ریزجلبک دونالیلا
عنوان مقاله: بررسی امکان استفاده از پلی مورفیسم ژن 16SrDNA کلروپلاستی در شناسایی و طبقه بندی ریزجلبک دونالیلا
شناسه ملی مقاله: CIGS12_0728
منتشر شده در دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران در سال 1391
شناسه ملی مقاله: CIGS12_0728
منتشر شده در دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران در سال 1391
مشخصات نویسندگان مقاله:
گوهر تاج شیخ پروین - پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، منطقه شمالغرب و غرب کشور، تبریز، ایران
محمدامین حجازی - پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، منطقه شمالغرب و غرب کشور، تبریز، ایران
ناهید حسین زاده - پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، منطقه شمالغرب و غرب کشور، تبریز، ایران
خلاصه مقاله:
گوهر تاج شیخ پروین - پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، منطقه شمالغرب و غرب کشور، تبریز، ایران
محمدامین حجازی - پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، منطقه شمالغرب و غرب کشور، تبریز، ایران
ناهید حسین زاده - پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، منطقه شمالغرب و غرب کشور، تبریز، ایران
در تشخیص روابط فیلوژنتیکی جلبکهای سبز از مارکرهای مولکولی شامل ژنهای هسته ای (185rDNA, ITS) و ژنهای کلروپلاستی (16S rDNA, PcaB) استفاده می شود. مطالعات براساس 18S rDNA و ITS در مورد جلبک دونالیلا در ایران در پژوهشکده بیوتکنولوژی شمالغرب و غرب کشور صورت گرفته است و 20 ایزوله در سایت بانک جهانی NCBI به ثبت رسیده است. در این تحقیق برای اولین بار در دنیا، به بررسی پلی مورفیسمی ژن 16S Rdna لروپلاستی جنس دونالیلا پرداخته شده است. ژن 16S rDNA که جزء ژنهای حفاظت شده است، اندازه ای در حدود 1200 جفت باز دارد. جهت جداسازی این ژن، ابتدا تنها توالی 16S rDNA ثبت شده در بانک ژنی NCBI که مربوط به گونه دونالیلا سالینا بود، جمع آوری شد و با کمک برنامه Oligo5 بهترین جفت پرایمر از دو انتهای ژن طراحی گردید. 8 ایزوله از بانک جلبک پژوهشکده بیوتکنولوژی شمالغرب و غرب کشور انتخاب شدند و ژن 16S rDNA آنها توسط واکنش PCR تکثیر یافت. اندازه باند به دست آمده در حدود 1200 جفت باز بود. قابل ذکر است که مراحل تکمیلی این تحقیق در حال انجام بوده و نتایج حاصل از توالی یابی این ژن گزارش خواهد شد.
کلمات کلیدی: جلبک سبز، دونالیلاف پلی مورفیسم، کلروپلاست، 16S Rdna
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/226998/