معرفی و ارزیابی تکثیر نشانگرهای EST-SSR در گیاه آلوروپوس لیتورالیس
Publish place: 12th Congress of Iranian Genetics Society
Publish Year: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 961
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS12_0738
تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392
Abstract:
پیشرفت های اخیر در زمینه مطالعات ژنومی، منجر به تولید انبوهی از ترادف بیان شونده ی نشاندار EST) در بسیاری از موجودات، بویژه گونه های گیاهی شده است. در این مطالعه با داده کاوی مجموعه ترادف های EST گزارش شده در ژن بانک NCBI، برای جنس آلوروپوس (Aeluropus)، ترادف های حاوی توالی های تکراری ساده (SSR) شناسایی شدند و در مرحله بعد پس از سنتز پرایمرهای مناسب توانایی تکثیر و ایجاد چندشکلی در برخی از اکوتیپ های گونه لیتورالیس (A.littoralis) ارزیابی شد. نتایج نشان داد که از مجموع EST, 611 مورد بررسی تعداد 44 مورد حاوی نواحی ریزماهواره هستند که از این تعداد در 20 مورد طول و شرایط نواحی مجاور موتیف های SSR برای طراحی پرایمر مناسب تشخیص داده شد. همچنین نتایج بدست آمده از تکثیر جفت پرایمرها با استفاده از DNA ژنومی اکوتیپ های مختلف نشان می دهد که تمامی پرایمرهای طراحی شده توانایی تکثیر در تمام اکتیپ ها ندارند و چند شکلی مشاهده شده در لوکوس های تکثیر شده، بخوبی بر تنوع نواحی عملکردی ژنوم دلالت دارد.
Keywords:
Authors
مریم میدانسری
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
قربانعلی نعمت زاده
استاد دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
احسان شکری
کارشناس ارشد اصلاح نباتات، عضو هیئت علمی پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان
حشمت الله رحیمیان
استاد دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :